More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4253 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  100 
 
 
366 aa  729    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  99.73 
 
 
367 aa  728    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  96.99 
 
 
361 aa  646    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  86.58 
 
 
344 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  92.97 
 
 
352 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  93.29 
 
 
352 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  90.03 
 
 
339 aa  531  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  79.88 
 
 
350 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  81.9 
 
 
340 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  81.59 
 
 
340 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  81.59 
 
 
338 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  81.59 
 
 
338 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  79.27 
 
 
345 aa  525  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  81.59 
 
 
338 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  81.85 
 
 
340 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  54.63 
 
 
326 aa  321  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  51.61 
 
 
316 aa  305  6e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  50.8 
 
 
330 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  48.74 
 
 
307 aa  293  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0727  transglutaminase family protein  51.62 
 
 
296 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4491  transglutaminase domain-containing protein  51.8 
 
 
296 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  0.176228 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  51.3 
 
 
296 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  51.47 
 
 
319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0069  transglutaminase-like  48.48 
 
 
303 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0045  transglutaminase-like protein  47.78 
 
 
300 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607602  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  47.5 
 
 
320 aa  252  6e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  45.66 
 
 
319 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3008  transglutaminase-like  47.59 
 
 
321 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  44.12 
 
 
332 aa  245  9e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2603  transglutaminase domain-containing protein  43.96 
 
 
417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.767969 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  44.48 
 
 
317 aa  243  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  43.56 
 
 
293 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  45.37 
 
 
304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0657  transglutaminase domain-containing protein  44.55 
 
 
297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013619 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  41.8 
 
 
297 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  43.32 
 
 
292 aa  230  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  42.17 
 
 
296 aa  228  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  41.85 
 
 
297 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  42.07 
 
 
292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  40.33 
 
 
304 aa  225  9e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5652  hypothetical protein  43.95 
 
 
311 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  41.27 
 
 
300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  39.35 
 
 
293 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12589  hypothetical protein  44.44 
 
 
314 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  41.18 
 
 
292 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  40.85 
 
 
292 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65050  hypothetical protein  42.68 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00894338  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  41.18 
 
 
305 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  45.05 
 
 
299 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2322  transglutaminase-like protein  41.18 
 
 
305 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2369  transglutaminase domain-containing protein  41.18 
 
 
305 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2949  putative transaminase-like enzyme  42.76 
 
 
292 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3769  transglutaminase domain-containing protein  40.38 
 
 
310 aa  210  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  43.73 
 
 
304 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  41.75 
 
 
294 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  40.2 
 
 
295 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  42.58 
 
 
300 aa  207  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  38.17 
 
 
310 aa  206  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  40.65 
 
 
292 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  40.97 
 
 
299 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  43.05 
 
 
299 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  39.8 
 
 
299 aa  203  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  37.34 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  40.19 
 
 
316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  42.09 
 
 
300 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  41.64 
 
 
292 aa  199  7.999999999999999e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.867984 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  39.35 
 
 
304 aa  196  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3417  transglutaminase domain-containing protein  41.46 
 
 
300 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.331503  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3647  transglutaminase domain protein  39.33 
 
 
292 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0166  transglutaminase domain protein  40.71 
 
 
308 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0772661  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3755  hypothetical protein  38.31 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3345  transglutaminase domain protein  37.67 
 
 
292 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2737  transglutaminase domain-containing protein  37.5 
 
 
292 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215869  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4760  transglutaminase domain-containing protein  37.66 
 
 
292 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0619763  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3610  transglutaminase domain protein  41.35 
 
 
298 aa  170  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0089149  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0855  transglutaminase domain protein  37.63 
 
 
295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21199  normal  0.166966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  35.46 
 
 
326 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07510  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  35.76 
 
 
339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  34.87 
 
 
280 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  37.3 
 
 
280 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  34.39 
 
 
283 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  34.97 
 
 
308 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  34.42 
 
 
279 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  37.01 
 
 
280 aa  146  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  35.67 
 
 
279 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  35.67 
 
 
279 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  35.67 
 
 
279 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  35.06 
 
 
279 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  34.74 
 
 
265 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  31.92 
 
 
283 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  35.81 
 
 
314 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  33.75 
 
 
279 aa  142  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  35.71 
 
 
311 aa  142  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  33.66 
 
 
269 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  33.24 
 
 
654 aa  139  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3019  transglutaminase domain-containing protein  35.14 
 
 
293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.798249  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  33.98 
 
 
292 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  33.98 
 
 
266 aa  133  5e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  32.25 
 
 
276 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  30.16 
 
 
308 aa  132  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>