More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1215 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 280 aa  561  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  61.87 
 
 		 279 aa  362  4e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  61.51 
 
 		 279 aa  360  1e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  61.51 
 
 		 279 aa  360  1e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  61.51 
 
 		 279 aa  360  1e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  60.43 
 
 		 279 aa  354  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  59.29 
 
 		 280 aa  353  2e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  62.5 
 
 		 280 aa  345  7e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  60.79 
 
 		 279 aa  331  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  55.87 
 
 		 281 aa  300  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2203  transglutaminase domain protein  49.28 
 
 		 279 aa  242  6e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.424742  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  47.65 
 
 		 279 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  45.55 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  44.84 
 
 		 283 aa  228  6e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  42.62 
 
 		 314 aa  222  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  38.85 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  39.37 
 
 		 311 aa  185  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  39.44 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  36.4 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  35.69 
 
 		 323 aa  175  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  41.01 
 
 		 277 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  38.81 
 
 		 316 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  34.39 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  36.59 
 
 		 272 aa  169  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  34.6 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  35.09 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  33.57 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  39.86 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  34.97 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5721  transglutaminase domain protein  35.54 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  35.79 
 
 		 308 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  37.77 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  38.78 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  37.33 
 
 		 299 aa  155  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  34.92 
 
 		 292 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  35.93 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  37.37 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  35.57 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  37.3 
 
 		 366 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  37.3 
 
 		 367 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  36.66 
 
 		 361 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  37.67 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  36.73 
 
 		 266 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  35.14 
 
 		 330 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  36.73 
 
 		 266 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  33.56 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  36.66 
 
 		 344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  35.66 
 
 		 304 aa  145  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  36.22 
 
 		 352 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  35.36 
 
 		 299 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  35.23 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.867984 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  37.46 
 
 		 350 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  37.46 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  36.77 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  33.56 
 
 		 292 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  37.46 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  37.14 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  37.46 
 
 		 340 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  35.25 
 
 		 292 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  36.22 
 
 		 352 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  32.53 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  37.5 
 
 		 345 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  37.13 
 
 		 340 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  37.13 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  37.13 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  37.13 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  34.36 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  34.93 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  33.68 
 
 		 654 aa  139  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0166  transglutaminase domain protein  37.54 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0772661  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  35.31 
 
 		 299 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  35.08 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  36.43 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3345  transglutaminase domain protein  34.75 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  35.15 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12589  hypothetical protein  37.18 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  29.9 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3647  transglutaminase domain protein  34.75 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  36.11 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  36.27 
 
 		 310 aa  132  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3769  transglutaminase domain-containing protein  37.19 
 
 		 310 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4760  transglutaminase domain-containing protein  33.68 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0619763  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  34.95 
 
 		 300 aa  132  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3610  transglutaminase domain protein  35.09 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0089149  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  32.43 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  35.66 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  36.55 
 
 		 319 aa  129  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2322  transglutaminase-like protein  36.01 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2369  transglutaminase domain-containing protein  36.01 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3417  transglutaminase domain-containing protein  34.95 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.331503  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0069  transglutaminase-like  36.56 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  32.49 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0045  transglutaminase-like protein  36 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07510  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  36.03 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  32 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  30.69 
 
 		 273 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  31.85 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  35.69 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>