More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4573 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  100 
 
 
314 aa  642    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  45.39 
 
 
283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  45.7 
 
 
279 aa  251  8.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  44.71 
 
 
283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  45.39 
 
 
280 aa  243  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  44.71 
 
 
280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  43.69 
 
 
280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  41.16 
 
 
279 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  41.5 
 
 
279 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  40.48 
 
 
279 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  40.48 
 
 
279 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  40.48 
 
 
279 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2203  transglutaminase domain protein  43.99 
 
 
279 aa  221  9e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.424742  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  41.16 
 
 
279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  40.96 
 
 
281 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  38.68 
 
 
277 aa  191  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  34.48 
 
 
308 aa  159  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  32.89 
 
 
273 aa  154  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  35.71 
 
 
352 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  35.71 
 
 
361 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  36.04 
 
 
344 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  36.04 
 
 
367 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  36.04 
 
 
366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  35.23 
 
 
326 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  35.39 
 
 
352 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  32.86 
 
 
291 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  34.26 
 
 
323 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  34.81 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  35 
 
 
340 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  34.88 
 
 
345 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  30.87 
 
 
285 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  35 
 
 
350 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  35 
 
 
340 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  35.66 
 
 
316 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  34.67 
 
 
338 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  34.67 
 
 
338 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  34.67 
 
 
340 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  34.67 
 
 
338 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  33.78 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  30.2 
 
 
272 aa  140  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  34.02 
 
 
316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  35.55 
 
 
293 aa  139  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  29.87 
 
 
272 aa  138  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0166  transglutaminase domain protein  37.06 
 
 
308 aa  136  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0772661  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  35.14 
 
 
320 aa  136  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5721  transglutaminase domain protein  34 
 
 
292 aa  136  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  35.23 
 
 
300 aa  135  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
295 aa  135  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  30.64 
 
 
272 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  32.8 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  33.66 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  34.27 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  30.64 
 
 
272 aa  132  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  32 
 
 
288 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  30.59 
 
 
293 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  33.77 
 
 
339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12589  hypothetical protein  34.84 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  33.68 
 
 
304 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  31.54 
 
 
318 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  34.51 
 
 
299 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  31.33 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  32.19 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  30.32 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  35.56 
 
 
299 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  31.27 
 
 
326 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  33.45 
 
 
269 aa  126  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  33.99 
 
 
305 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  33.81 
 
 
276 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  32.32 
 
 
259 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  33.45 
 
 
276 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2737  transglutaminase domain-containing protein  33.47 
 
 
292 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215869  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2322  transglutaminase-like protein  33.99 
 
 
305 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2369  transglutaminase domain-containing protein  33.99 
 
 
305 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  31.99 
 
 
259 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  31.99 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4760  transglutaminase domain-containing protein  30.85 
 
 
292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0619763  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3769  transglutaminase domain-containing protein  33.78 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  31.06 
 
 
265 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  30.41 
 
 
317 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  31.76 
 
 
292 aa  119  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.867984 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  32.55 
 
 
310 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  32.75 
 
 
294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0657  transglutaminase domain-containing protein  30.46 
 
 
297 aa  116  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013619 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0855  transglutaminase domain protein  31.72 
 
 
295 aa  116  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21199  normal  0.166966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  30.95 
 
 
299 aa  116  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  32.99 
 
 
292 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  31.88 
 
 
300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  31.85 
 
 
259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  31.54 
 
 
304 aa  115  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  32.18 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  29.7 
 
 
654 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  31.51 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  31.99 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  33.45 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  28.9 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  31.53 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  30.3 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  31.53 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  29.76 
 
 
292 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  32.78 
 
 
304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>