More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1871 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  100 
 
 		 276 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  98.55 
 
 		 276 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  82.72 
 
 		 269 aa  471  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  80.31 
 
 		 265 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  68.48 
 
 		 266 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  68.48 
 
 		 266 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  66.41 
 
 		 259 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  66.02 
 
 		 259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  66.41 
 
 		 259 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  66.02 
 
 		 259 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  57.31 
 
 		 264 aa  297  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  55.17 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  51.15 
 
 		 273 aa  264  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  44.02 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  38.7 
 
 		 265 aa  195  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  40.66 
 
 		 281 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  41.98 
 
 		 266 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  39.42 
 
 		 281 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  41.06 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  40.75 
 
 		 274 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  43.23 
 
 		 273 aa  185  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  40 
 
 		 274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  39.11 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  40.3 
 
 		 287 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  42.08 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  41.7 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  39.03 
 
 		 268 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  39.47 
 
 		 275 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  39.46 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  39.46 
 
 		 286 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  36.36 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  37.73 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  39.03 
 
 		 282 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  37.69 
 
 		 278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  37.64 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  35.97 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  38.49 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  37.46 
 
 		 274 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  37.46 
 
 		 274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  37.32 
 
 		 299 aa  158  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  37.17 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  38.58 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  36.74 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  37.45 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  36.9 
 
 		 265 aa  155  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  34.86 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  35.21 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  35.74 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  36.74 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  38.93 
 
 		 266 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  33.71 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  33.92 
 
 		 271 aa  142  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  34.24 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  35.16 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  33.33 
 
 		 272 aa  136  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  34.55 
 
 		 319 aa  135  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  34.07 
 
 		 272 aa  136  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  33.94 
 
 		 273 aa  135  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  32.47 
 
 		 344 aa  135  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  32.33 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  32.4 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  33.11 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  33.09 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  31.27 
 
 		 366 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  31.27 
 
 		 367 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  31.92 
 
 		 361 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  32.66 
 
 		 300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  32.89 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  32.4 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  30.62 
 
 		 352 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  32.88 
 
 		 299 aa  128  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  30.62 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3417  transglutaminase domain-containing protein  32.32 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.331503  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  30.32 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  33.11 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  30.8 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  32.36 
 
 		 272 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  32.33 
 
 		 330 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  30.58 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  30 
 
 		 283 aa  125  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  31.27 
 
 		 292 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  31.39 
 
 		 308 aa  125  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  32.41 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  29.9 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  31.29 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  30.19 
 
 		 339 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  32.06 
 
 		 310 aa  122  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  31.29 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  34.67 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3610  transglutaminase domain protein  31.74 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0089149  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  30.74 
 
 		 345 aa  122  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  30.36 
 
 		 283 aa  122  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  31.82 
 
 		 316 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0069  transglutaminase-like  35.34 
 
 		 303 aa  122  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  28.36 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  29.97 
 
 		 340 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  30.29 
 
 		 350 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  31.18 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  30.58 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  31.97 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>