More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3244 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  100 
 
 		 278 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  57.89 
 
 		 270 aa  326  3e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  56.36 
 
 		 274 aa  322  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  55.64 
 
 		 274 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  54.95 
 
 		 272 aa  311  9e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  55.26 
 
 		 265 aa  310  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  55.85 
 
 		 266 aa  307  1.0000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  53.65 
 
 		 273 aa  285  5e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  51.45 
 
 		 274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  49.81 
 
 		 265 aa  281  6.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  52.12 
 
 		 267 aa  272  5.000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  42.39 
 
 		 275 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  45.66 
 
 		 268 aa  205  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  42.29 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  44.73 
 
 		 273 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  41.7 
 
 		 269 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  41.82 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  41.82 
 
 		 274 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  41.04 
 
 		 287 aa  198  9e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  42.64 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  41.2 
 
 		 296 aa  195  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  41.2 
 
 		 286 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  41.95 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  39.92 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  41.7 
 
 		 269 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1779  hypothetical protein  34.29 
 
 		 318 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.605837  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0677  hypothetical protein  34.29 
 
 		 318 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2039  hypothetical protein  34.29 
 
 		 318 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.254849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2054  transglutaminase-like superfamily protein  34.29 
 
 		 318 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0768  hypothetical protein  34.29 
 
 		 318 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0771  hypothetical protein  34.29 
 
 		 318 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1064  hypothetical protein  34.29 
 
 		 318 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1920  transglutaminase-like domain-containing protein  34.6 
 
 		 318 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  38.95 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  40.36 
 
 		 275 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  37.84 
 
 		 273 aa  178  9e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  37.84 
 
 		 273 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  38.02 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  37.12 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  38.32 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  40.89 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  37.69 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  40.89 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  38.27 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  39.38 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  38.22 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  37.68 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  40.29 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  38.2 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  36.67 
 
 		 266 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  38.81 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  35.82 
 
 		 265 aa  162  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  37.04 
 
 		 266 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  35.13 
 
 		 311 aa  159  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  34.4 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  34.77 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  36.46 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  33.81 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  35.64 
 
 		 281 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  35.84 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4004  transglutaminase domain-containing protein  36.63 
 
 		 334 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.218888  normal  0.154625 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3521  transglutaminase domain-containing protein  36.63 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  34.55 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  31.01 
 
 		 323 aa  142  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  33.21 
 
 		 272 aa  143  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3413  transglutaminase domain-containing protein  36.45 
 
 		 335 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.452972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4256  transglutaminase-like  36.45 
 
 		 335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0500098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4110  transglutaminase domain-containing protein  36.45 
 
 		 335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1934  transglutaminase-like enzyme putative cysteine protease-like  35.96 
 
 		 329 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156381  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  33.82 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  31.4 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  33.94 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  31.73 
 
 		 273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  29.82 
 
 		 318 aa  132  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  32.48 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  31.75 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3538  transglutaminase domain-containing protein  32.53 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.802983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  30.63 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  31.37 
 
 		 272 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  33.22 
 
 		 288 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4109  transglutaminase domain-containing protein  37.95 
 
 		 331 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  31.02 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  32.62 
 
 		 293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  28.53 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  31.72 
 
 		 299 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  30.94 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  29.97 
 
 		 345 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  30.72 
 
 		 338 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  30.72 
 
 		 340 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  30.72 
 
 		 338 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  30.72 
 
 		 338 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  29.68 
 
 		 654 aa  112  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  30.39 
 
 		 350 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  30.46 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  30.39 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  29.35 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0727  transglutaminase family protein  30 
 
 		 296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  30.07 
 
 		 340 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  31.43 
 
 		 280 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  28.87 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>