256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3521 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3521  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 338 aa  683    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4004  transglutaminase domain-containing protein  96.15 
 
 		 334 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.218888  normal  0.154625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1934  transglutaminase-like enzyme putative cysteine protease-like  88.5 
 
 		 329 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156381  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4110  transglutaminase domain-containing protein  88.79 
 
 		 335 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4256  transglutaminase-like  88.5 
 
 		 335 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0500098  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3413  transglutaminase domain-containing protein  88.5 
 
 		 335 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.452972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4109  transglutaminase domain-containing protein  79.29 
 
 		 331 aa  501  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1920  transglutaminase-like domain-containing protein  64.2 
 
 		 318 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0768  hypothetical protein  64.2 
 
 		 318 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1779  hypothetical protein  64.12 
 
 		 318 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.605837  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2039  hypothetical protein  64.12 
 
 		 318 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.254849  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0677  hypothetical protein  63.24 
 
 		 318 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2054  transglutaminase-like superfamily protein  63.24 
 
 		 318 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0771  hypothetical protein  64.12 
 
 		 318 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1064  hypothetical protein  64.12 
 
 		 318 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  47.03 
 
 		 265 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  40.1 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  43.56 
 
 		 272 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  39.6 
 
 		 274 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  36.2 
 
 		 274 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  42.08 
 
 		 270 aa  159  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  36.63 
 
 		 278 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  39.49 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  40.8 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  41.87 
 
 		 267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  37.62 
 
 		 273 aa  126  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3538  transglutaminase domain-containing protein  30.72 
 
 		 289 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.802983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  35.38 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  37.56 
 
 		 269 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  32.82 
 
 		 273 aa  109  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 275 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  39.39 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  32.99 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  36.55 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  37.56 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  34.52 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  32.49 
 
 		 264 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  33.17 
 
 		 273 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  31.98 
 
 		 274 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  32.84 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  36 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  31 
 
 		 279 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  33 
 
 		 286 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  33 
 
 		 296 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  35.9 
 
 		 266 aa  99  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  27.86 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  35.2 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  33.67 
 
 		 263 aa  97.1  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  36.23 
 
 		 282 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  31.28 
 
 		 259 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  37.37 
 
 		 278 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  35.38 
 
 		 266 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  32.81 
 
 		 269 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  31.47 
 
 		 276 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  31.47 
 
 		 276 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  31.79 
 
 		 259 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  28.64 
 
 		 265 aa  89.7  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  34.36 
 
 		 275 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  31.28 
 
 		 266 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  31.13 
 
 		 291 aa  86.3  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  30.77 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  32.86 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  27.04 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  28.33 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  30.26 
 
 		 259 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  30.26 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  32.18 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  31.71 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  27.7 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  30.37 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  31.07 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  27.14 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  23.12 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  27.8 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  23.79 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  27.36 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  25 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  23.1 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  22.53 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3512  transglutaminase domain protein  23.49 
 
 		 1141 aa  66.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  29.69 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  29.91 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  21.78 
 
 		 272 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  29.91 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  25 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  25.62 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  29.91 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  29.46 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  29.46 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  29.46 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  29.46 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  24.01 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  24.46 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22850  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  28.74 
 
 		 259 aa  59.3  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  28.57 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  27.56 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  28 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  28 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  47.06 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  27.11 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>