More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0538 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 264 aa  553  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  65.02 
 
 		 273 aa  354  7.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  64.64 
 
 		 273 aa  350  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  57.31 
 
 		 276 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  56.54 
 
 		 276 aa  295  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  56.81 
 
 		 259 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  55.94 
 
 		 265 aa  290  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  57.2 
 
 		 259 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  54.58 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  54.58 
 
 		 269 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  54.58 
 
 		 266 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  56.81 
 
 		 259 aa  274  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  55.64 
 
 		 259 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  43.77 
 
 		 263 aa  214  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  40 
 
 		 292 aa  198  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  39.05 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  38.18 
 
 		 281 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  38.89 
 
 		 287 aa  185  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  39.03 
 
 		 286 aa  185  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  42.02 
 
 		 265 aa  185  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  38.66 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  40.67 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  38.35 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  40.3 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  41.51 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  38.29 
 
 		 291 aa  175  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  37.12 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  38.72 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  40.38 
 
 		 279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  38.6 
 
 		 273 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  39 
 
 		 282 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  38.49 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  38.87 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  39.41 
 
 		 282 aa  165  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  38.35 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  37.36 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  36.47 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  36.3 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  37.83 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  36.53 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  38.2 
 
 		 275 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  37.45 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  35.71 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  34.09 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  35.74 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  36.19 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  34.6 
 
 		 265 aa  145  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  35.34 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  35.09 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  35.25 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  31.91 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  33.79 
 
 		 304 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 326 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  32.84 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  35.09 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  32.61 
 
 		 272 aa  132  6e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  33.69 
 
 		 285 aa  129  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  31.1 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  30.63 
 
 		 279 aa  129  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  34.32 
 
 		 273 aa  129  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  29.69 
 
 		 304 aa  128  8.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  29.51 
 
 		 292 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  30.56 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  29.89 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  34.21 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  31.48 
 
 		 275 aa  125  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  30.17 
 
 		 344 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  29.93 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  29.93 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  29.93 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  29.86 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  30.17 
 
 		 367 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  30 
 
 		 345 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  30.17 
 
 		 366 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  30.54 
 
 		 330 aa  122  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  30.5 
 
 		 311 aa  122  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0727  transglutaminase family protein  30.42 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  30.6 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  29.33 
 
 		 340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  29.03 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  29.33 
 
 		 350 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  31.62 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  29.15 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  30.8 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.867984 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  32.1 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  30.63 
 
 		 319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  30.74 
 
 		 318 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  28.38 
 
 		 352 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  29 
 
 		 338 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  28.9 
 
 		 340 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  29 
 
 		 340 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  29 
 
 		 338 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  29 
 
 		 338 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1779  hypothetical protein  29.43 
 
 		 318 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.605837  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0771  hypothetical protein  29.43 
 
 		 318 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2039  hypothetical protein  29.43 
 
 		 318 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.254849  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0677  hypothetical protein  29.43 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1064  hypothetical protein  29.43 
 
 		 318 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0768  hypothetical protein  29.43 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  28.14 
 
 		 352 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>