More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3108 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 259 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  91.12 
 
 		 259 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  90.35 
 
 		 259 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  88.03 
 
 		 259 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  67.97 
 
 		 269 aa  362  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  66.41 
 
 		 276 aa  361  6e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  66.02 
 
 		 276 aa  358  5e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  67.19 
 
 		 265 aa  354  5.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  66.8 
 
 		 266 aa  349  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  66.41 
 
 		 266 aa  345  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  55.64 
 
 		 264 aa  288  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  52.49 
 
 		 273 aa  265  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  51.15 
 
 		 273 aa  259  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  44.53 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  41.85 
 
 		 281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  41.48 
 
 		 281 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  41.29 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  40.91 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  40.37 
 
 		 292 aa  192  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  39.42 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  40.07 
 
 		 286 aa  186  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  40.07 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  40.53 
 
 		 268 aa  185  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  38.97 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  40.81 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  41.89 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  37.5 
 
 		 265 aa  182  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  41.51 
 
 		 274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  39.86 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  38.2 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  38.78 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  40 
 
 		 272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  40.6 
 
 		 275 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  39.47 
 
 		 279 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  39.25 
 
 		 273 aa  171  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  39.48 
 
 		 282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  39.69 
 
 		 282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  39.31 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  37.79 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  36.09 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  35.93 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  35.34 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  35.74 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  35.98 
 
 		 274 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  37.88 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  37.79 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  33.46 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  37.22 
 
 		 266 aa  145  8.000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  36.78 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  35.52 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  34.29 
 
 		 311 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  31.65 
 
 		 280 aa  138  7.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  34.43 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  34.6 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  34.29 
 
 		 316 aa  135  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  33.21 
 
 		 323 aa  132  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  33.08 
 
 		 304 aa  132  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  33.8 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  30.07 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  31.21 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  30.8 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  29.96 
 
 		 279 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  29.96 
 
 		 279 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  29.96 
 
 		 279 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  33.1 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  35.49 
 
 		 294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  32.09 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  32.32 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  31.88 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  31.71 
 
 		 304 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  31.9 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  32.23 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  30.85 
 
 		 344 aa  125  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  32.22 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  30.98 
 
 		 340 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  30.98 
 
 		 340 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  30.98 
 
 		 350 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  31.32 
 
 		 308 aa  125  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  31.5 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  30.64 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  32.84 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  30.64 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  30.64 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  30.51 
 
 		 367 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  30.64 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  33.45 
 
 		 320 aa  123  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  30.58 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  30.51 
 
 		 366 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  31.6 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  30.17 
 
 		 361 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  33.56 
 
 		 296 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  30.51 
 
 		 352 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  31.27 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  33.46 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  33.68 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  33.22 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  33.46 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  32.53 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0045  transglutaminase-like protein  34.17 
 
 		 300 aa  118  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  31.1 
 
 		 281 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>