More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4007 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 352 aa  707    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  98.58 
 
 		 352 aa  699    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  87.11 
 
 		 344 aa  598  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  84.85 
 
 		 361 aa  594  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  92.97 
 
 		 366 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  92.97 
 
 		 367 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  92.31 
 
 		 339 aa  547  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  81.33 
 
 		 338 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  81.33 
 
 		 340 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  81.33 
 
 		 340 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  81.65 
 
 		 340 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  81.33 
 
 		 338 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  81.33 
 
 		 338 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  81.65 
 
 		 350 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  80.7 
 
 		 345 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  54.14 
 
 		 326 aa  316  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  51.61 
 
 		 316 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  50.8 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  48.28 
 
 		 307 aa  295  7e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0727  transglutaminase family protein  50.65 
 
 		 296 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  50.65 
 
 		 296 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  50.81 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4491  transglutaminase domain-containing protein  50.49 
 
 		 296 aa  277  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  0.176228 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2603  transglutaminase domain-containing protein  43.67 
 
 		 417 aa  255  8e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.767969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0069  transglutaminase-like  47.87 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  46.39 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0045  transglutaminase-like protein  46.76 
 
 		 300 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3008  transglutaminase-like  46.15 
 
 		 321 aa  243  5e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  43.14 
 
 		 332 aa  242  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  43.89 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  44.59 
 
 		 319 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  45.86 
 
 		 304 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  42.44 
 
 		 317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  41.83 
 
 		 297 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  43.23 
 
 		 292 aa  232  9e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0657  transglutaminase domain-containing protein  43.27 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5652  hypothetical protein  44.34 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  42.12 
 
 		 296 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  40.58 
 
 		 304 aa  229  4e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  40.84 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  42.07 
 
 		 292 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65050  hypothetical protein  42.86 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00894338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  41.46 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  43.09 
 
 		 299 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  40 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2322  transglutaminase-like protein  40 
 
 		 305 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2369  transglutaminase domain-containing protein  40 
 
 		 305 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  38.49 
 
 		 293 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  40.13 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  40.78 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3769  transglutaminase domain-containing protein  40.62 
 
 		 310 aa  212  9e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  39.38 
 
 		 310 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  41.77 
 
 		 300 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  42.9 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12589  hypothetical protein  43.75 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  43.41 
 
 		 304 aa  209  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2949  putative transaminase-like enzyme  40.98 
 
 		 292 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  40.82 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  40.78 
 
 		 295 aa  207  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  41.99 
 
 		 300 aa  206  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  41.21 
 
 		 292 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  41.39 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  38.76 
 
 		 299 aa  203  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  37.66 
 
 		 291 aa  202  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3417  transglutaminase domain-containing protein  40.82 
 
 		 300 aa  202  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.331503  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  40.75 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.867984 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  41.1 
 
 		 316 aa  198  9e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0166  transglutaminase domain protein  40.84 
 
 		 308 aa  192  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0772661  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  39.03 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3755  hypothetical protein  38.81 
 
 		 292 aa  190  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3647  transglutaminase domain protein  38.21 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2737  transglutaminase domain-containing protein  36.86 
 
 		 292 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3345  transglutaminase domain protein  36.54 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4760  transglutaminase domain-containing protein  36.69 
 
 		 292 aa  179  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0619763  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3610  transglutaminase domain protein  41.03 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0089149  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0855  transglutaminase domain protein  38.46 
 
 		 295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21199  normal  0.166966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  34.85 
 
 		 326 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07510  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  36.19 
 
 		 339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  36.39 
 
 		 280 aa  156  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  33.55 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  34.17 
 
 		 283 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  35.83 
 
 		 280 aa  146  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  35.71 
 
 		 314 aa  146  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  36.22 
 
 		 280 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  34.2 
 
 		 279 aa  143  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  32.58 
 
 		 283 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  33.88 
 
 		 279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  33.88 
 
 		 279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  33.88 
 
 		 279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  33.77 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  34.28 
 
 		 654 aa  139  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  33.77 
 
 		 265 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  32.68 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  31.87 
 
 		 279 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  34.42 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  32.8 
 
 		 273 aa  134  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  31.11 
 
 		 285 aa  134  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  31.08 
 
 		 266 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  31.08 
 
 		 266 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  33.44 
 
 		 266 aa  132  7.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>