More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3679 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 299 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  68.57 
 
 		 292 aa  413  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.867984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  56.51 
 
 		 292 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  56.51 
 
 		 292 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  56.16 
 
 		 292 aa  341  7e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2949  putative transaminase-like enzyme  53.98 
 
 		 292 aa  334  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  53.92 
 
 		 299 aa  330  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  53.77 
 
 		 292 aa  328  8e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  52.54 
 
 		 299 aa  323  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  52.51 
 
 		 300 aa  322  6e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  54.58 
 
 		 299 aa  322  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  53.22 
 
 		 304 aa  316  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3417  transglutaminase domain-containing protein  52.68 
 
 		 300 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.331503  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3610  transglutaminase domain protein  53.38 
 
 		 298 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0089149  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  49.83 
 
 		 294 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  46.84 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  46.08 
 
 		 300 aa  261  6.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  42.71 
 
 		 304 aa  258  7e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4760  transglutaminase domain-containing protein  45.17 
 
 		 292 aa  256  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0619763  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  44.07 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2737  transglutaminase domain-containing protein  41.24 
 
 		 292 aa  245  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3755  hypothetical protein  42.96 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  42.62 
 
 		 316 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3647  transglutaminase domain protein  44.33 
 
 		 292 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  44.67 
 
 		 317 aa  238  9e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  42.02 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3345  transglutaminase domain protein  43.64 
 
 		 292 aa  235  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3019  transglutaminase domain-containing protein  42.96 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.798249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0952  transglutaminase-like protein  44.86 
 
 		 294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  44.26 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  41.04 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2612  transglutaminase domain-containing protein  43.84 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5652  hypothetical protein  42.18 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  42.23 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  42.91 
 
 		 293 aa  226  4e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0657  transglutaminase domain-containing protein  42.28 
 
 		 297 aa  224  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013619 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  42.12 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  44.52 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  42.31 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  40.75 
 
 		 332 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65050  hypothetical protein  41.69 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00894338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  41.44 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4491  transglutaminase domain-containing protein  43 
 
 		 296 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  0.176228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  41.02 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3008  transglutaminase-like  44.74 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0727  transglutaminase family protein  43.64 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0069  transglutaminase-like  41.82 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  39.87 
 
 		 352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  39.55 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  40.6 
 
 		 330 aa  212  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  40.39 
 
 		 367 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  40.39 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  40.07 
 
 		 361 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  40.79 
 
 		 344 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  40.72 
 
 		 338 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  40.72 
 
 		 338 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  40.72 
 
 		 340 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  40.72 
 
 		 338 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  41.37 
 
 		 345 aa  208  8e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  40.72 
 
 		 340 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  40.72 
 
 		 350 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0855  transglutaminase domain protein  38.7 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21199  normal  0.166966 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  40.51 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  36.77 
 
 		 293 aa  205  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0045  transglutaminase-like protein  40.43 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2603  transglutaminase domain-containing protein  46.03 
 
 		 417 aa  202  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.767969 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  39.09 
 
 		 339 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  37.16 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0166  transglutaminase domain protein  39.02 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0772661  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  36.86 
 
 		 291 aa  195  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3769  transglutaminase domain-containing protein  40.27 
 
 		 310 aa  192  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  40.61 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  38.62 
 
 		 300 aa  188  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2322  transglutaminase-like protein  41.08 
 
 		 305 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2369  transglutaminase domain-containing protein  41.08 
 
 		 305 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  41.08 
 
 		 305 aa  188  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  40.2 
 
 		 316 aa  185  8e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07510  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  38 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12589  hypothetical protein  38.95 
 
 		 314 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  36.03 
 
 		 304 aa  169  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  32.51 
 
 		 279 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  34.72 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  34.71 
 
 		 308 aa  152  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  34.24 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  32.63 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  31.71 
 
 		 308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  34.36 
 
 		 323 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  33.9 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2203  transglutaminase domain protein  31.91 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.424742  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  35.14 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  30.85 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  31.31 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  35.31 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  31.86 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  30.07 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  32.18 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  32.99 
 
 		 279 aa  139  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  33.68 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  30.99 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  31.8 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>