More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0952 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0952  transglutaminase-like protein  100 
 
 
294 aa  587  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2612  transglutaminase domain-containing protein  97.96 
 
 
294 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3019  transglutaminase domain-containing protein  84.93 
 
 
293 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.798249  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3345  transglutaminase domain protein  48.8 
 
 
292 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0855  transglutaminase domain protein  49.32 
 
 
295 aa  273  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21199  normal  0.166966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3647  transglutaminase domain protein  48.45 
 
 
292 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3755  hypothetical protein  46.74 
 
 
292 aa  268  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2737  transglutaminase domain-containing protein  45.7 
 
 
292 aa  265  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215869  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  48.45 
 
 
299 aa  238  8e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  44.86 
 
 
292 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  46.96 
 
 
300 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2949  putative transaminase-like enzyme  44.78 
 
 
292 aa  232  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  44.86 
 
 
299 aa  229  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3417  transglutaminase domain-containing protein  46.96 
 
 
300 aa  228  9e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.331503  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  43.43 
 
 
292 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  45.73 
 
 
294 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  44.63 
 
 
292 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4760  transglutaminase domain-containing protein  46.76 
 
 
292 aa  221  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0619763  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  45.26 
 
 
292 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.867984 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  43.34 
 
 
292 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  45.73 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  45.24 
 
 
304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  42.81 
 
 
299 aa  209  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3610  transglutaminase domain protein  47.46 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0089149  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  37.33 
 
 
300 aa  182  7e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  34.36 
 
 
304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0657  transglutaminase domain-containing protein  37.16 
 
 
297 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  35.14 
 
 
291 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  37.25 
 
 
326 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  39.54 
 
 
320 aa  172  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  38.21 
 
 
317 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  34.59 
 
 
332 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  36.15 
 
 
304 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  33.7 
 
 
292 aa  169  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  35.02 
 
 
297 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0069  transglutaminase-like  38.77 
 
 
303 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4491  transglutaminase domain-containing protein  38.1 
 
 
296 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  0.176228 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  34.11 
 
 
316 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  33.77 
 
 
293 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  35.1 
 
 
297 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  34.58 
 
 
296 aa  165  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5652  hypothetical protein  36.15 
 
 
311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  36.84 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0045  transglutaminase-like protein  37.37 
 
 
300 aa  161  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607602  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65050  hypothetical protein  35.1 
 
 
311 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00894338  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0727  transglutaminase family protein  36.71 
 
 
296 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  33.01 
 
 
307 aa  155  8e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  33.56 
 
 
295 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3008  transglutaminase-like  35.62 
 
 
321 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  36.52 
 
 
293 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0166  transglutaminase domain protein  33.99 
 
 
308 aa  149  7e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0772661  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  34.72 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2603  transglutaminase domain-containing protein  51.63 
 
 
417 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.767969 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  35.69 
 
 
319 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  33.67 
 
 
300 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  32.17 
 
 
319 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  34.19 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  34.19 
 
 
367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  35.76 
 
 
345 aa  136  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  33.55 
 
 
344 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  36.01 
 
 
340 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  33.12 
 
 
361 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  36.01 
 
 
340 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  36.01 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  36.01 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  36.01 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  36.01 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  35.69 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  34.34 
 
 
304 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  33.22 
 
 
316 aa  132  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  32.48 
 
 
352 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  32.88 
 
 
308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  32.59 
 
 
352 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12589  hypothetical protein  35 
 
 
314 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3769  transglutaminase domain-containing protein  35.02 
 
 
310 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  32.31 
 
 
305 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2322  transglutaminase-like protein  33.86 
 
 
305 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2369  transglutaminase domain-containing protein  33.86 
 
 
305 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  33.23 
 
 
339 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07510  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  31.82 
 
 
339 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  34.67 
 
 
281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  26.5 
 
 
308 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  33.72 
 
 
310 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  31.41 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  32.25 
 
 
323 aa  116  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  29.12 
 
 
654 aa  112  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  29.87 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  30.95 
 
 
279 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  32.73 
 
 
280 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  32.65 
 
 
281 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  30.92 
 
 
279 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  33.94 
 
 
277 aa  106  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  32.09 
 
 
271 aa  106  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  28.72 
 
 
318 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  32.5 
 
 
311 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  29.86 
 
 
280 aa  105  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  30.88 
 
 
279 aa  105  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  29.93 
 
 
272 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  29.19 
 
 
283 aa  105  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  32.31 
 
 
292 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>