More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3759 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
311 aa  640    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  82.24 
 
 
316 aa  499  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  57.28 
 
 
323 aa  360  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  60.71 
 
 
308 aa  341  9e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  54.76 
 
 
318 aa  335  5e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  50.85 
 
 
326 aa  271  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  38.67 
 
 
285 aa  198  9e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  39.08 
 
 
273 aa  195  6e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  39.3 
 
 
272 aa  190  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  39.65 
 
 
272 aa  189  7e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  39.3 
 
 
272 aa  189  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  39.79 
 
 
272 aa  188  8e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  39.37 
 
 
280 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  35 
 
 
308 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5721  transglutaminase domain protein  38.91 
 
 
292 aa  175  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  39.25 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  36.43 
 
 
279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  37.59 
 
 
292 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  38.43 
 
 
280 aa  172  6.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  35.84 
 
 
295 aa  172  9e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  34.64 
 
 
280 aa  170  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  36.3 
 
 
279 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  36.3 
 
 
279 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  36.3 
 
 
279 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  34.54 
 
 
332 aa  169  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  39.27 
 
 
288 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  35.46 
 
 
279 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  35.07 
 
 
304 aa  165  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  37.21 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  34.16 
 
 
279 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  35.42 
 
 
292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  34.58 
 
 
291 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3769  transglutaminase domain-containing protein  38.57 
 
 
310 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  38.23 
 
 
310 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  35.13 
 
 
278 aa  159  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  36.33 
 
 
292 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2949  putative transaminase-like enzyme  35.4 
 
 
292 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2322  transglutaminase-like protein  38.64 
 
 
305 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  38.64 
 
 
305 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2369  transglutaminase domain-containing protein  38.64 
 
 
305 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  36.59 
 
 
287 aa  159  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  35.86 
 
 
319 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  34.12 
 
 
654 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  38.98 
 
 
293 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  37.18 
 
 
279 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2203  transglutaminase domain protein  37.59 
 
 
279 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.424742  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  35.81 
 
 
326 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  35.5 
 
 
316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  36.84 
 
 
281 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  35.49 
 
 
292 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0657  transglutaminase domain-containing protein  35.99 
 
 
297 aa  152  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013619 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  35.11 
 
 
296 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  35.11 
 
 
286 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  33 
 
 
293 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  31.9 
 
 
274 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  38 
 
 
300 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  37.58 
 
 
319 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  32.62 
 
 
274 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  33.81 
 
 
269 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  36.09 
 
 
330 aa  149  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  33.79 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  34.72 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5652  hypothetical protein  35.96 
 
 
311 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4760  transglutaminase domain-containing protein  36.73 
 
 
292 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0619763  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  34.03 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  33.33 
 
 
265 aa  145  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  35.1 
 
 
320 aa  145  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  35 
 
 
274 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65050  hypothetical protein  35.64 
 
 
311 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00894338  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  34.98 
 
 
283 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  34.47 
 
 
297 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  31.43 
 
 
265 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  35 
 
 
274 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  34.41 
 
 
275 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  35.35 
 
 
344 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  35.94 
 
 
270 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12589  hypothetical protein  37.18 
 
 
314 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  34.89 
 
 
292 aa  143  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.867984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  35.04 
 
 
282 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  35.55 
 
 
281 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  34.38 
 
 
296 aa  142  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  35.17 
 
 
281 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  36.86 
 
 
304 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  37.92 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  35.06 
 
 
361 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  35.71 
 
 
366 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  35.71 
 
 
367 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  35.96 
 
 
316 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  34.81 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  35.39 
 
 
340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  34.1 
 
 
352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  35.39 
 
 
338 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  35.39 
 
 
338 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  35.39 
 
 
338 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  33.45 
 
 
269 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  36.68 
 
 
304 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  33.77 
 
 
352 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  33.9 
 
 
317 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  31.54 
 
 
272 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  34.42 
 
 
345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>