More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5652 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5652  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65050  hypothetical protein  88.96 
 
 
311 aa  551  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00894338  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0657  transglutaminase domain-containing protein  75.51 
 
 
297 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  71.43 
 
 
296 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  69.49 
 
 
297 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  72.24 
 
 
304 aa  435  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  68.81 
 
 
297 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3008  transglutaminase-like  58.67 
 
 
321 aa  330  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  56.48 
 
 
320 aa  301  6.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  49.16 
 
 
332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  47.1 
 
 
304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  47.81 
 
 
317 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  48.5 
 
 
319 aa  264  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  50.52 
 
 
293 aa  263  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  45.39 
 
 
293 aa  259  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  46.71 
 
 
326 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  47.77 
 
 
296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  44.52 
 
 
295 aa  254  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0727  transglutaminase family protein  47.06 
 
 
296 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2603  transglutaminase domain-containing protein  42.21 
 
 
417 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.767969 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  44.48 
 
 
292 aa  246  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  46 
 
 
316 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  45.42 
 
 
292 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  41.1 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  44.22 
 
 
300 aa  238  9e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  44.55 
 
 
330 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  46.1 
 
 
292 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  46.69 
 
 
338 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  46.69 
 
 
338 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  46.56 
 
 
350 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  46.69 
 
 
338 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  46.69 
 
 
340 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0069  transglutaminase-like  42.81 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  46.69 
 
 
340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  46.69 
 
 
340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  45.25 
 
 
352 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4491  transglutaminase domain-containing protein  43.4 
 
 
296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  0.176228 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  40.26 
 
 
307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  44.65 
 
 
345 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  45.25 
 
 
352 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  42.81 
 
 
304 aa  229  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  45.36 
 
 
319 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  44.27 
 
 
344 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0045  transglutaminase-like protein  43.42 
 
 
300 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607602  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  44.86 
 
 
292 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  43.95 
 
 
366 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  43.95 
 
 
367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  43.63 
 
 
361 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  44.18 
 
 
292 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  42.27 
 
 
299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  41.21 
 
 
316 aa  216  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  41.88 
 
 
292 aa  212  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.867984 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  42.46 
 
 
339 aa  211  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2322  transglutaminase-like protein  40.26 
 
 
305 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2369  transglutaminase domain-containing protein  40.26 
 
 
305 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  41.69 
 
 
300 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2949  putative transaminase-like enzyme  41.78 
 
 
292 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  39.93 
 
 
305 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  40.48 
 
 
299 aa  205  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  41.55 
 
 
299 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  42.33 
 
 
300 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  38.46 
 
 
310 aa  202  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3769  transglutaminase domain-containing protein  39.46 
 
 
310 aa  201  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3417  transglutaminase domain-containing protein  42 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.331503  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0166  transglutaminase domain protein  41.22 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0772661  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12589  hypothetical protein  39.39 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  40.4 
 
 
299 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  41.89 
 
 
304 aa  195  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  41.16 
 
 
294 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4760  transglutaminase domain-containing protein  38.57 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0619763  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2737  transglutaminase domain-containing protein  38.18 
 
 
292 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215869  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3610  transglutaminase domain protein  43.96 
 
 
298 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0089149  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07510  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  39.46 
 
 
339 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0855  transglutaminase domain protein  39.69 
 
 
295 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21199  normal  0.166966 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3755  hypothetical protein  36.36 
 
 
292 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2612  transglutaminase domain-containing protein  36.15 
 
 
294 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3345  transglutaminase domain protein  35.02 
 
 
292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0952  transglutaminase-like protein  35.47 
 
 
294 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3019  transglutaminase domain-containing protein  35.84 
 
 
293 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.798249  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3647  transglutaminase domain protein  35.86 
 
 
292 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  31.38 
 
 
308 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  35.96 
 
 
311 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  34.01 
 
 
308 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
318 aa  142  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  33.11 
 
 
326 aa  139  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  34.71 
 
 
268 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  35.27 
 
 
316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2469  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 
313 aa  132  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.451679 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  32.44 
 
 
280 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3862  transglutaminase domain protein  32.09 
 
 
335 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168309 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  34.69 
 
 
323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  34.81 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  30.77 
 
 
283 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  31.4 
 
 
266 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  30.87 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  32.42 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  32.42 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  32.42 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  30.82 
 
 
272 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  30.58 
 
 
266 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>