More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7512 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 282 aa  569  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  88.46 
 
 		 278 aa  474  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  64.13 
 
 		 287 aa  362  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  64.81 
 
 		 286 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  64.81 
 
 		 296 aa  352  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  58.12 
 
 		 275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  50 
 
 		 274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  49.46 
 
 		 275 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  50 
 
 		 274 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  48.24 
 
 		 279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  50.37 
 
 		 282 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  41.61 
 
 		 273 aa  202  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  38.77 
 
 		 275 aa  199  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  39.57 
 
 		 274 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  39.57 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  42.65 
 
 		 269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3538  transglutaminase domain-containing protein  37.04 
 
 		 289 aa  195  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.802983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  44.36 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  44.36 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  41.4 
 
 		 276 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  41.05 
 
 		 276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  42.38 
 
 		 268 aa  188  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  42.26 
 
 		 265 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  38.57 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  41.83 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  38.57 
 
 		 272 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  37.91 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  42.31 
 
 		 269 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  39 
 
 		 264 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  40.59 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  40.38 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  37.31 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  39.62 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  37.5 
 
 		 266 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  36.84 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  39.62 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  42.31 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  38.75 
 
 		 270 aa  158  8e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  36.98 
 
 		 265 aa  158  8e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  37.87 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  38.35 
 
 		 266 aa  155  9e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  37.41 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  36.97 
 
 		 291 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  37 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  33.82 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  40 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  35.71 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  35.51 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  39.55 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  38.35 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  35.21 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  35.36 
 
 		 311 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  35.92 
 
 		 281 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  38.26 
 
 		 268 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  34.52 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  34.93 
 
 		 272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  35.74 
 
 		 272 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 		 326 aa  135  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  32.27 
 
 		 318 aa  135  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  35.48 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  32.38 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  36.07 
 
 		 272 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  35.59 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  34.42 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  32.48 
 
 		 273 aa  125  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  29.76 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  30.48 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  32.51 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  32.47 
 
 		 272 aa  122  9e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  32.91 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1920  transglutaminase-like domain-containing protein  32.35 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2054  transglutaminase-like superfamily protein  31.17 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0768  hypothetical protein  31.17 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0677  hypothetical protein  31.17 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  32.25 
 
 		 285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1779  hypothetical protein  31.17 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.605837  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1064  hypothetical protein  31.17 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0771  hypothetical protein  31.17 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2039  hypothetical protein  31.17 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.254849  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  31.19 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  33.12 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4491  transglutaminase domain-containing protein  31.6 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  0.176228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  33.45 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  33.21 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  33.21 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  33.21 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  34.57 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5652  hypothetical protein  32.55 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  30.77 
 
 		 654 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  31.16 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  31.35 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  31.83 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65050  hypothetical protein  31.97 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00894338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0657  transglutaminase domain-containing protein  29.45 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  28.62 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  29.05 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  28.36 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  31.77 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>