More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2238 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  100 
 
 		 274 aa  560  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  91.97 
 
 		 274 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  84 
 
 		 275 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  74.46 
 
 		 279 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  76.03 
 
 		 282 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  51.99 
 
 		 287 aa  289  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  52.24 
 
 		 286 aa  285  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  52.24 
 
 		 296 aa  285  8e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  50.19 
 
 		 282 aa  262  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  49.81 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  50.36 
 
 		 275 aa  251  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  41.09 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3538  transglutaminase domain-containing protein  40.91 
 
 		 289 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.802983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  46.72 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  41.82 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  42.75 
 
 		 274 aa  205  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  43.66 
 
 		 268 aa  205  6e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  41.82 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  42.64 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  43.17 
 
 		 266 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  42.18 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  41.79 
 
 		 265 aa  192  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  41.13 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  40.73 
 
 		 272 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  40.75 
 
 		 276 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  39.38 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  41.7 
 
 		 265 aa  186  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  40.38 
 
 		 259 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  40.38 
 
 		 259 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  39.18 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  39.77 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  38.46 
 
 		 273 aa  175  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  42.03 
 
 		 281 aa  175  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  37.32 
 
 		 274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  39.38 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  41.89 
 
 		 259 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  39.64 
 
 		 273 aa  171  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  39.11 
 
 		 273 aa  171  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  40 
 
 		 270 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  41.88 
 
 		 281 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  38.81 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  38.49 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  39.85 
 
 		 263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  41.51 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  37.69 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  39.49 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  36.4 
 
 		 268 aa  158  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  37.23 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  36.94 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0768  hypothetical protein  32.6 
 
 		 318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2054  transglutaminase-like superfamily protein  32.6 
 
 		 318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  35 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0677  hypothetical protein  32.6 
 
 		 318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1779  hypothetical protein  32.6 
 
 		 318 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.605837  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1064  hypothetical protein  32.6 
 
 		 318 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2039  hypothetical protein  32.6 
 
 		 318 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.254849  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0771  hypothetical protein  32.6 
 
 		 318 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  35 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  33.7 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  33.68 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  31.76 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  31.21 
 
 		 308 aa  138  7.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  35.48 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  36.46 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  30.41 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1920  transglutaminase-like domain-containing protein  30.5 
 
 		 318 aa  136  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  32.43 
 
 		 326 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  31.47 
 
 		 323 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  32.39 
 
 		 654 aa  125  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  31.25 
 
 		 326 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  30.69 
 
 		 330 aa  122  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  30.15 
 
 		 273 aa  120  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  31.03 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  33.57 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  28.12 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  29.56 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  30.26 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  29.01 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  30.15 
 
 		 272 aa  116  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  30.66 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  26.87 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  27.01 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  32.76 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  29.11 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  29.27 
 
 		 319 aa  113  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  30.99 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  31.51 
 
 		 293 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  29.41 
 
 		 272 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  28.57 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  31.14 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  26.19 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  27.12 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  30.94 
 
 		 285 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  31.69 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  33.78 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  30.28 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  27.92 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  26.48 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  30.8 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>