More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2490 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  100 
 
 
296 aa  600  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  99.3 
 
 
286 aa  577  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  92 
 
 
287 aa  511  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  66.18 
 
 
275 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  67.82 
 
 
278 aa  352  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  65.9 
 
 
282 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  50.69 
 
 
279 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  51.81 
 
 
275 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  54.65 
 
 
282 aa  292  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  52.17 
 
 
274 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  52.17 
 
 
274 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  45.62 
 
 
273 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  42.45 
 
 
274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  42.09 
 
 
274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  44.61 
 
 
268 aa  209  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3538  transglutaminase domain-containing protein  40.77 
 
 
289 aa  208  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.802983  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  41.43 
 
 
278 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  40.67 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  40.94 
 
 
272 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  43.68 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  40.14 
 
 
274 aa  195  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  42.11 
 
 
269 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  39.35 
 
 
275 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  41.3 
 
 
266 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  43.22 
 
 
263 aa  193  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  41.3 
 
 
266 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  43.68 
 
 
269 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  39.7 
 
 
265 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  38.75 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  39.85 
 
 
276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  39.55 
 
 
265 aa  178  7e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  37.93 
 
 
273 aa  179  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  38.06 
 
 
259 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  38.95 
 
 
276 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  38.06 
 
 
259 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  41.29 
 
 
267 aa  177  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  43.3 
 
 
268 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  39.16 
 
 
292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  40.15 
 
 
259 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  38.93 
 
 
281 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  38.81 
 
 
270 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  39.26 
 
 
273 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  40.07 
 
 
259 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  38.63 
 
 
281 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  39.18 
 
 
266 aa  169  6e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  37.69 
 
 
268 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  40.29 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  37.08 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  36.04 
 
 
291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  36.97 
 
 
266 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  34.8 
 
 
265 aa  158  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  34.83 
 
 
311 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  34.62 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  32.76 
 
 
316 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  35.71 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  36.46 
 
 
288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  32.75 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  34.18 
 
 
272 aa  139  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  30.6 
 
 
318 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  31.1 
 
 
293 aa  132  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  31.1 
 
 
295 aa  132  9e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0768  hypothetical protein  30.86 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2054  transglutaminase-like superfamily protein  30.86 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  30.36 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0677  hypothetical protein  30.86 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1779  hypothetical protein  30.86 
 
 
318 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.605837  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0771  hypothetical protein  30.86 
 
 
318 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1064  hypothetical protein  30.86 
 
 
318 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2039  hypothetical protein  30.86 
 
 
318 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.254849  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1934  transglutaminase-like enzyme putative cysteine protease-like  31.23 
 
 
329 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156381  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  30.31 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  29.15 
 
 
291 aa  126  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  32.97 
 
 
271 aa  125  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  31.29 
 
 
272 aa  124  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  33.1 
 
 
280 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  29.69 
 
 
304 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  30.72 
 
 
316 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  32.97 
 
 
277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  31.91 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  28.94 
 
 
272 aa  119  6e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  35 
 
 
294 aa  118  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  32.3 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  29.82 
 
 
654 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  28.93 
 
 
272 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  29.29 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  28.88 
 
 
332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  31.35 
 
 
293 aa  116  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  29.71 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4491  transglutaminase domain-containing protein  31.16 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  0.176228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  32.86 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  31.74 
 
 
304 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  33.45 
 
 
304 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  29.83 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  32.51 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  29.79 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  32.51 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  27.54 
 
 
273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  32.51 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  29.15 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  27.96 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>