More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0878 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
266 aa  545  1e-154  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  30.4 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  30.42 
 
 
311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  31.15 
 
 
266 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  26.62 
 
 
279 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  28.83 
 
 
308 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  27.5 
 
 
279 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  28.06 
 
 
280 aa  122  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  27.21 
 
 
654 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  30.83 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  30.31 
 
 
316 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  29.41 
 
 
352 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  28.88 
 
 
281 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  29.53 
 
 
319 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  29.87 
 
 
361 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  30.48 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  28.06 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  30.56 
 
 
330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  28.06 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  30.19 
 
 
367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  28.06 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  29.97 
 
 
344 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  30.19 
 
 
366 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  28.67 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  29.32 
 
 
352 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  29.54 
 
 
323 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  27.27 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  29.35 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  30.68 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  29.68 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  29.13 
 
 
340 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  29.13 
 
 
350 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  29.13 
 
 
339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  30.69 
 
 
326 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  29.13 
 
 
340 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2949  putative transaminase-like enzyme  28.37 
 
 
292 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  28.8 
 
 
338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  28.8 
 
 
338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  28.8 
 
 
338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  28.22 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  28.8 
 
 
340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  29.73 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  30.07 
 
 
304 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2322  transglutaminase-like protein  28.22 
 
 
305 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  29.23 
 
 
266 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  27.61 
 
 
295 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2369  transglutaminase domain-containing protein  28.22 
 
 
305 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  26.64 
 
 
293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  26.86 
 
 
320 aa  109  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  26.76 
 
 
317 aa  109  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22850  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  31.4 
 
 
259 aa  108  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  28.52 
 
 
286 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  26.32 
 
 
280 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3769  transglutaminase domain-containing protein  28.03 
 
 
310 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  26.85 
 
 
273 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  27.99 
 
 
292 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  26.73 
 
 
326 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0166  transglutaminase domain protein  27.52 
 
 
308 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0772661  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2203  transglutaminase domain protein  28.93 
 
 
279 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.424742  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  28.72 
 
 
299 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  27.09 
 
 
293 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  31.1 
 
 
292 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  28.37 
 
 
318 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  26.35 
 
 
279 aa  106  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  28.16 
 
 
296 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  28.57 
 
 
292 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  28.29 
 
 
269 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  28.04 
 
 
259 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  28.01 
 
 
296 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  27.34 
 
 
272 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  28.23 
 
 
259 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  26.45 
 
 
272 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  26.28 
 
 
310 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  29.27 
 
 
294 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  26.97 
 
 
272 aa  103  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3417  transglutaminase domain-containing protein  27.49 
 
 
300 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.331503  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  27.54 
 
 
281 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  27.49 
 
 
300 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  26.81 
 
 
279 aa  102  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  28.92 
 
 
292 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  26.09 
 
 
285 aa  102  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  28.19 
 
 
276 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  27.63 
 
 
265 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  27.21 
 
 
319 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  27.27 
 
 
273 aa  102  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  28.62 
 
 
292 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  28.92 
 
 
300 aa  102  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  25.41 
 
 
307 aa  102  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5721  transglutaminase domain protein  28.32 
 
 
292 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  27.68 
 
 
259 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  27.13 
 
 
276 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  27.56 
 
 
283 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  26.41 
 
 
304 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  26.87 
 
 
281 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  26.97 
 
 
316 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0727  transglutaminase family protein  27.66 
 
 
296 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  26.69 
 
 
332 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  27.54 
 
 
282 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  31.32 
 
 
266 aa  99.4  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4491  transglutaminase domain-containing protein  27.14 
 
 
296 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  0.176228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>