More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2775 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  100 
 
 
261 aa  531  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  47.66 
 
 
260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  46.09 
 
 
258 aa  228  6e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  44.79 
 
 
254 aa  209  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  42.47 
 
 
261 aa  206  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  41.57 
 
 
257 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  39.23 
 
 
298 aa  171  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  34.72 
 
 
285 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  36.86 
 
 
321 aa  162  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  32.96 
 
 
281 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  38.37 
 
 
289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  34.36 
 
 
286 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  34.87 
 
 
286 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
327 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  30.8 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  33.98 
 
 
286 aa  146  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  33.98 
 
 
286 aa  146  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  35.1 
 
 
298 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  35.85 
 
 
267 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  33.58 
 
 
367 aa  145  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  36.05 
 
 
284 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  33.08 
 
 
286 aa  143  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  45.57 
 
 
263 aa  143  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  34.9 
 
 
268 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  46.84 
 
 
272 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  46.84 
 
 
272 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  46.84 
 
 
272 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  33.58 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  36.33 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  32.83 
 
 
286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  43.06 
 
 
268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  40.45 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  31 
 
 
293 aa  132  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  31.42 
 
 
288 aa  132  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  44.37 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  43.4 
 
 
279 aa  129  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  31.27 
 
 
291 aa  125  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  38.22 
 
 
276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  29.12 
 
 
271 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  35.6 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  31.25 
 
 
276 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  32.58 
 
 
266 aa  108  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  32.97 
 
 
295 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  32.3 
 
 
279 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  32.3 
 
 
279 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  28.41 
 
 
264 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  30.86 
 
 
279 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  35.12 
 
 
266 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  32.18 
 
 
272 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  26.12 
 
 
267 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  28.84 
 
 
265 aa  99  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  30.35 
 
 
283 aa  97.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  33.89 
 
 
270 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  34.5 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  34.09 
 
 
275 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  32.78 
 
 
277 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  33.52 
 
 
270 aa  95.5  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  33.52 
 
 
268 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  32.78 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  33.73 
 
 
267 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  31.68 
 
 
282 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  33.15 
 
 
280 aa  93.2  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  33.89 
 
 
283 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  33.52 
 
 
280 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  25.37 
 
 
290 aa  92.4  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  31.65 
 
 
310 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  34.84 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  32.97 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  32.39 
 
 
276 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  27.94 
 
 
275 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  29.41 
 
 
280 aa  89.7  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  31.25 
 
 
270 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  29.55 
 
 
273 aa  89.4  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  29.24 
 
 
278 aa  88.6  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  28.88 
 
 
275 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  27.14 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  32.3 
 
 
269 aa  86.3  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  26.57 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  27.08 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  32.39 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  32 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  30.57 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  26.67 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  28.46 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  28.05 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  25.82 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  25.88 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  27.31 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  26.98 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  25 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  37.07 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  29.72 
 
 
274 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  29.73 
 
 
279 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  29.73 
 
 
279 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  29.73 
 
 
279 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
314 aa  62.8  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  29.88 
 
 
1305 aa  62.8  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  30.22 
 
 
259 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  29.53 
 
 
280 aa  62.4  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>