More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0068 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  100 
 
 
281 aa  577  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  75.8 
 
 
284 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  56.1 
 
 
298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  53.85 
 
 
291 aa  270  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  47.47 
 
 
281 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  48.97 
 
 
298 aa  237  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  45.35 
 
 
286 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  44.96 
 
 
286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  43.35 
 
 
286 aa  222  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  44.96 
 
 
286 aa  221  9e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  47.6 
 
 
327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  42.98 
 
 
282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  43.3 
 
 
286 aa  208  9e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  44.03 
 
 
321 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  43.78 
 
 
285 aa  194  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  38.58 
 
 
288 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  42.22 
 
 
367 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  40.96 
 
 
286 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  43.09 
 
 
293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  41.25 
 
 
257 aa  178  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  37.45 
 
 
260 aa  175  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  37.8 
 
 
271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  39.15 
 
 
267 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  42.08 
 
 
261 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  38.76 
 
 
290 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  37 
 
 
310 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  40 
 
 
270 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  40.53 
 
 
276 aa  168  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  39.32 
 
 
275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  37.45 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  40.08 
 
 
277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  38.08 
 
 
254 aa  161  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  35.97 
 
 
283 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  37.01 
 
 
282 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  37.3 
 
 
264 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  37.79 
 
 
273 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  41.13 
 
 
295 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  37.17 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  38.06 
 
 
282 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  37.01 
 
 
279 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  38.31 
 
 
260 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  37.01 
 
 
279 aa  153  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  35.46 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  36.68 
 
 
290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  40.34 
 
 
263 aa  151  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  35.8 
 
 
279 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  41.87 
 
 
280 aa  149  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  34.9 
 
 
258 aa  149  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  42.5 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  35.77 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  35.85 
 
 
275 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  36.29 
 
 
280 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  40.91 
 
 
280 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  35.77 
 
 
275 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  37.23 
 
 
268 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  36.63 
 
 
266 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  37.17 
 
 
280 aa  143  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  37.23 
 
 
276 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  39.52 
 
 
270 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  39.91 
 
 
292 aa  142  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  39.52 
 
 
270 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  43.94 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  37.18 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  35.02 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  37.29 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  35.32 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  37.29 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  37.29 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  33.58 
 
 
261 aa  140  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  34.96 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  39.2 
 
 
294 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  36.4 
 
 
289 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  34.8 
 
 
273 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  39.08 
 
 
271 aa  136  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  35.71 
 
 
267 aa  136  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  40.7 
 
 
264 aa  135  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  40.1 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  32.68 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  37.72 
 
 
294 aa  133  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  36.32 
 
 
267 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  34.93 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  33.09 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  34.47 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  32.59 
 
 
280 aa  92.8  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  30.51 
 
 
272 aa  87.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  40 
 
 
280 aa  85.1  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  33.33 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  35.46 
 
 
274 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  33.56 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  32.2 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  38.79 
 
 
314 aa  82.8  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  33.55 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  41.28 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  30.3 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  32.69 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  41.03 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  38.26 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  30.84 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>