More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2253 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  100 
 
 		 310 aa  646    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  93.64 
 
 		 283 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  85.41 
 
 		 282 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  80.92 
 
 		 277 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  66.18 
 
 		 295 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  65.82 
 
 		 282 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  66.05 
 
 		 272 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  64.58 
 
 		 279 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  63.6 
 
 		 279 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  63.24 
 
 		 279 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  61.34 
 
 		 276 aa  353  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  61.42 
 
 		 268 aa  347  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  58.65 
 
 		 275 aa  346  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  58.21 
 
 		 270 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  60.98 
 
 		 269 aa  342  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  61.05 
 
 		 267 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  58.46 
 
 		 280 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  58.15 
 
 		 275 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  60.07 
 
 		 280 aa  331  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  56.52 
 
 		 280 aa  330  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  55.43 
 
 		 290 aa  317  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  55.27 
 
 		 280 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  54.21 
 
 		 273 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  54.07 
 
 		 283 aa  310  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  50.87 
 
 		 290 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  53.09 
 
 		 275 aa  308  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  53.33 
 
 		 279 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  52.43 
 
 		 267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  53.11 
 
 		 275 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  56.72 
 
 		 292 aa  306  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  52.42 
 
 		 278 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  55.02 
 
 		 271 aa  295  7e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  54.34 
 
 		 276 aa  292  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  52.57 
 
 		 272 aa  281  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  53.36 
 
 		 294 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  53.18 
 
 		 270 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  53.18 
 
 		 270 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  48.09 
 
 		 294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  49.78 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  41.22 
 
 		 271 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  40.46 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  43.08 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  38.32 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  37.63 
 
 		 276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  39.51 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  37.94 
 
 		 264 aa  178  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  38.55 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  37 
 
 		 281 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  36.99 
 
 		 284 aa  159  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  39.59 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  37.21 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  39.08 
 
 		 298 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  40.32 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  35.36 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  33.7 
 
 		 282 aa  145  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  32.24 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  41.67 
 
 		 293 aa  139  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  33.46 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  31.7 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  31.7 
 
 		 286 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  32.43 
 
 		 281 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  32.69 
 
 		 286 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  31.71 
 
 		 367 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  32.69 
 
 		 286 aa  132  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  32.2 
 
 		 286 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  43.6 
 
 		 257 aa  122  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  35.21 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  35.2 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  27.65 
 
 		 268 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  31.92 
 
 		 260 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  34.88 
 
 		 261 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  37.14 
 
 		 263 aa  98.2  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  30.52 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  37.5 
 
 		 268 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  34.71 
 
 		 258 aa  96.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  31.65 
 
 		 261 aa  92  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  32.64 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  32.14 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  32.14 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  32.14 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  29.22 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  30.85 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  28.82 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  25.97 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  28.19 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  28.17 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  35.83 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  35.88 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2638  transglutaminase-like  33.55 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.947389  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  23.57 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  26.98 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  37.19 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  34.78 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  29.5 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  35.59 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  27.72 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  32.62 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  38.52 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2203  transglutaminase domain protein  41.49 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.424742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>