More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1588 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
298 aa  605  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  57.14 
 
 
286 aa  309  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  56.04 
 
 
286 aa  306  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  56.04 
 
 
286 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  51.28 
 
 
286 aa  279  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  50.75 
 
 
286 aa  276  4e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  50 
 
 
281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  50 
 
 
282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  47.13 
 
 
298 aa  248  7e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  46.47 
 
 
284 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  47.37 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  46.82 
 
 
285 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  48.97 
 
 
281 aa  237  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  44.74 
 
 
327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  45.93 
 
 
286 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  44.04 
 
 
367 aa  229  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  46.51 
 
 
321 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  43.98 
 
 
288 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  41.57 
 
 
293 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  43.49 
 
 
261 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  44.79 
 
 
257 aa  209  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  40.46 
 
 
271 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  39.77 
 
 
260 aa  175  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  37.22 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  39.23 
 
 
261 aa  171  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  37.27 
 
 
290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  40.16 
 
 
276 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  36.94 
 
 
267 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  36.16 
 
 
295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  37.31 
 
 
258 aa  165  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  38.46 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  38.62 
 
 
266 aa  163  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  35.25 
 
 
260 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  36.15 
 
 
254 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  34.19 
 
 
275 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  36.14 
 
 
264 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  35.93 
 
 
270 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  36.4 
 
 
273 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  37.77 
 
 
279 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  34.18 
 
 
280 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  37.77 
 
 
279 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  35.19 
 
 
270 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  34.51 
 
 
269 aa  152  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  34.07 
 
 
280 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  38.02 
 
 
264 aa  150  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  42.6 
 
 
263 aa  150  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  34.98 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  33.58 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  34.19 
 
 
270 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  37.45 
 
 
275 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  34.04 
 
 
283 aa  145  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  34.18 
 
 
279 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  31.94 
 
 
267 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  34.62 
 
 
277 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  36.54 
 
 
272 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  32.24 
 
 
310 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  36.54 
 
 
272 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  36.54 
 
 
272 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  33.46 
 
 
271 aa  143  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  33.59 
 
 
282 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  33.58 
 
 
283 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  33.69 
 
 
272 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  38.78 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  38.66 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  32.97 
 
 
275 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  33.46 
 
 
294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  33.09 
 
 
278 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  31.64 
 
 
268 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  35.63 
 
 
289 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  32.22 
 
 
275 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  32.59 
 
 
280 aa  135  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  31.8 
 
 
290 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  41.07 
 
 
292 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  31.12 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  40.49 
 
 
271 aa  133  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  31.5 
 
 
272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  33.73 
 
 
276 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  31.8 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
282 aa  132  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  30.4 
 
 
273 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  34.54 
 
 
268 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  39.39 
 
 
279 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  28.3 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  35.81 
 
 
272 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  30.39 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  28.31 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  29.6 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  33.91 
 
 
273 aa  79  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  28.23 
 
 
259 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  26.79 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  26.79 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  26.79 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  33.54 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  27.49 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  30.81 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  34 
 
 
285 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  26.53 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  35.29 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  32.87 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>