More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0886 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
280 aa  580  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  72.04 
 
 
290 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  71.79 
 
 
280 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  59.63 
 
 
282 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  60.07 
 
 
310 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  60.51 
 
 
280 aa  344  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  60.37 
 
 
283 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  58.12 
 
 
277 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  58.48 
 
 
295 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  58.05 
 
 
275 aa  335  7e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  56.99 
 
 
292 aa  330  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  54.51 
 
 
279 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  54.51 
 
 
279 aa  325  5e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  57.68 
 
 
268 aa  324  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  54.15 
 
 
279 aa  323  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  55.72 
 
 
275 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  54.28 
 
 
273 aa  316  3e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  53.9 
 
 
275 aa  315  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  56.18 
 
 
270 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  56.02 
 
 
269 aa  314  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  53.7 
 
 
279 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  54.24 
 
 
272 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  54.65 
 
 
278 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  56.41 
 
 
282 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  55.39 
 
 
276 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  57.09 
 
 
276 aa  308  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  55.02 
 
 
270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  51.27 
 
 
283 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  54.65 
 
 
270 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  52.38 
 
 
275 aa  298  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  52.92 
 
 
280 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  53.93 
 
 
267 aa  296  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  52.21 
 
 
272 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  52.77 
 
 
271 aa  285  5e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  51.15 
 
 
267 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  50.37 
 
 
294 aa  279  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  50.92 
 
 
294 aa  277  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  50 
 
 
290 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  45.7 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  37.36 
 
 
271 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  37.04 
 
 
288 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  36.12 
 
 
260 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  37.07 
 
 
266 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  42.47 
 
 
298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  35.75 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  39.61 
 
 
291 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  41.87 
 
 
281 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  32.71 
 
 
264 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  40.7 
 
 
284 aa  152  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  33.46 
 
 
265 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  34.32 
 
 
286 aa  150  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  45.18 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  37 
 
 
327 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  35.85 
 
 
286 aa  146  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  37.9 
 
 
281 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  34.65 
 
 
285 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  30.12 
 
 
266 aa  142  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  35.85 
 
 
293 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  32.59 
 
 
298 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  33.96 
 
 
286 aa  139  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  33.72 
 
 
286 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  33.96 
 
 
286 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  43.27 
 
 
367 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  31.62 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  30.2 
 
 
282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  34.25 
 
 
257 aa  119  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  37.24 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  28.42 
 
 
264 aa  103  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  30.77 
 
 
271 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  29.34 
 
 
261 aa  99.4  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  31.46 
 
 
268 aa  96.7  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  36.36 
 
 
268 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  33.33 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  35.62 
 
 
260 aa  94  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  32.98 
 
 
289 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  29.41 
 
 
261 aa  94  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  29.03 
 
 
269 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  37.16 
 
 
263 aa  90.1  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  35.19 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  26.88 
 
 
272 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  26.88 
 
 
272 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  26.88 
 
 
272 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  30.69 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  29.27 
 
 
280 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  38.14 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  26.69 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  28.68 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  27.75 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  31.33 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  35.34 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2203  transglutaminase domain protein  28.33 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.424742  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  29.63 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  27.98 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  26.47 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  35.65 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  27.57 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  31.53 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  26.39 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  26.72 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  28.5 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>