More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2841 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  100 
 
 
286 aa  586  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  99.3 
 
 
286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  93.33 
 
 
286 aa  551  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  78.32 
 
 
286 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  63.99 
 
 
286 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  56.04 
 
 
298 aa  306  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  48.47 
 
 
281 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  44.06 
 
 
284 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  44.88 
 
 
298 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  44.96 
 
 
281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  42.01 
 
 
282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  43.31 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  45.19 
 
 
291 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  38.7 
 
 
293 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  40.3 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  40 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  40.71 
 
 
285 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  37.15 
 
 
367 aa  192  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  37.41 
 
 
288 aa  183  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  39.62 
 
 
261 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  39.69 
 
 
257 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  36.99 
 
 
258 aa  166  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  37.16 
 
 
271 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  36.95 
 
 
260 aa  161  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  43.46 
 
 
276 aa  158  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  34.96 
 
 
295 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  35.09 
 
 
266 aa  155  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  41.21 
 
 
254 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  34.39 
 
 
260 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  36.02 
 
 
289 aa  149  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  34.56 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  33.98 
 
 
261 aa  146  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  39.09 
 
 
267 aa  146  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  33.83 
 
 
276 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  35.41 
 
 
290 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  33.71 
 
 
265 aa  142  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  41.28 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  35.8 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  35.34 
 
 
272 aa  138  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  32.08 
 
 
277 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  32.83 
 
 
283 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  32.82 
 
 
275 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  44.17 
 
 
268 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  32.7 
 
 
266 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  32.7 
 
 
264 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  45.16 
 
 
263 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  41.83 
 
 
268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  46.5 
 
 
264 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  36.63 
 
 
272 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  36.63 
 
 
272 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  36.63 
 
 
272 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  32.62 
 
 
279 aa  135  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  32.95 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  39.15 
 
 
269 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  34.39 
 
 
273 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  31.7 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  37.57 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  31.29 
 
 
279 aa  132  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  33.96 
 
 
280 aa  132  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  34.07 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  30.66 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  33.92 
 
 
283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  36.96 
 
 
279 aa  129  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  31.91 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  29.67 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  39.2 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  34.12 
 
 
280 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  32.96 
 
 
270 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  32.71 
 
 
279 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  29.43 
 
 
282 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  31.16 
 
 
294 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  40.48 
 
 
292 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  39.26 
 
 
280 aa  123  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  30.8 
 
 
267 aa  123  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  39.43 
 
 
270 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  30.31 
 
 
294 aa  122  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  30.86 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  38.67 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  31.77 
 
 
273 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  40.68 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  30.88 
 
 
275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  30.48 
 
 
278 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  29.67 
 
 
275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  25 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  25 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  25 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  25.86 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  27.44 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  31.69 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  30.22 
 
 
280 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  34.9 
 
 
272 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  32.45 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  37.75 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  33.14 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  31.79 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  35.29 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  32.76 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  31.54 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  32.67 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  30.87 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>