More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4408 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 266 aa  558  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  50.76 
 
 		 271 aa  275  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  51.15 
 
 		 288 aa  271  6e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  47.49 
 
 		 260 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  46.64 
 
 		 276 aa  246  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  41.76 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  42.7 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  44.21 
 
 		 266 aa  208  7e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  34.83 
 
 		 295 aa  182  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  36.36 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  39.16 
 
 		 270 aa  178  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  35.98 
 
 		 282 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  36.82 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  38.55 
 
 		 310 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  36.82 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  36.4 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  38.67 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  36.43 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  38.78 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  37.22 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  37.45 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  37.8 
 
 		 276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  36.82 
 
 		 284 aa  171  9e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  37.1 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  38.66 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  34.78 
 
 		 277 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  33.71 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  32.96 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  34.08 
 
 		 290 aa  165  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  35 
 
 		 280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  35.53 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  35.74 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  36.82 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  34.65 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  34.09 
 
 		 294 aa  162  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  34.44 
 
 		 275 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  37.17 
 
 		 269 aa  162  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  32.44 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  34.87 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  39.57 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  32.84 
 
 		 275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  33.21 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  32.58 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  36.54 
 
 		 271 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  32.96 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  35.46 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  34.33 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  36.05 
 
 		 294 aa  152  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  34.7 
 
 		 275 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  34.34 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  36.26 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  34.35 
 
 		 290 aa  148  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  38.94 
 
 		 321 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  45.12 
 
 		 293 aa  145  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  37.05 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  33.07 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  32.7 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  32.7 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  32.69 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  29.96 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  32.32 
 
 		 286 aa  135  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  30.12 
 
 		 280 aa  135  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  32.8 
 
 		 286 aa  135  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  42.86 
 
 		 367 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  35.06 
 
 		 257 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  32.33 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  37 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  29.28 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  34.1 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  40.24 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  35.81 
 
 		 271 aa  108  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  33.82 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  36.77 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  32.3 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  28.63 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  29.46 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  35.12 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  35.44 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  29.43 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  34.62 
 
 		 272 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  34.62 
 
 		 272 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  34.62 
 
 		 272 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  33.97 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  28.93 
 
 		 288 aa  89.4  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  30.65 
 
 		 269 aa  89  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  29.5 
 
 		 280 aa  88.6  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  32.38 
 
 		 273 aa  86.3  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  26.1 
 
 		 314 aa  85.9  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  31.47 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  29.71 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  29.71 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  29.71 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  27.59 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  30.14 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  27.8 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  25.1 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  27.44 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  27.86 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  26.74 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  27.73 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>