More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1401 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  100 
 
 
273 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  50.89 
 
 
282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  44.19 
 
 
275 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  42.16 
 
 
292 aa  225  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  43.07 
 
 
268 aa  224  9e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  49.78 
 
 
310 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  43.98 
 
 
273 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  44.94 
 
 
270 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  44.7 
 
 
280 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  52.27 
 
 
276 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  45.49 
 
 
270 aa  221  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  45.49 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  47.6 
 
 
283 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  42.86 
 
 
276 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  43.94 
 
 
269 aa  218  6e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  44.06 
 
 
288 aa  218  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  43.45 
 
 
278 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  41.73 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  51.33 
 
 
282 aa  215  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  43.23 
 
 
275 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  42.86 
 
 
275 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  41.35 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  41.73 
 
 
294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  48.05 
 
 
294 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  42.01 
 
 
279 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  43.22 
 
 
272 aa  211  9e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  43.23 
 
 
275 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  41.73 
 
 
295 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  48.15 
 
 
277 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  43.87 
 
 
280 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  47.53 
 
 
283 aa  208  9e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  43.12 
 
 
272 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  50.47 
 
 
279 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  44.79 
 
 
279 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  41.51 
 
 
280 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  49.29 
 
 
279 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  41.51 
 
 
290 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  40.61 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  47.71 
 
 
267 aa  198  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  42.22 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  45.7 
 
 
280 aa  192  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  40.94 
 
 
260 aa  187  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  38.81 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  41.9 
 
 
266 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  39.29 
 
 
276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  41.44 
 
 
298 aa  179  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  38.67 
 
 
266 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  37.85 
 
 
264 aa  175  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  41.22 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  35.04 
 
 
281 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  37.79 
 
 
281 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  36.4 
 
 
298 aa  156  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  45.05 
 
 
321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  36.12 
 
 
284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  39.06 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  43.66 
 
 
293 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  36.61 
 
 
286 aa  146  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  34.75 
 
 
286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  34.78 
 
 
286 aa  136  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  37.98 
 
 
367 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  34.39 
 
 
286 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  34.39 
 
 
286 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  38.94 
 
 
285 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  32.06 
 
 
282 aa  128  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  37.55 
 
 
286 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  38.31 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  40.91 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  38.82 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  35.94 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  34.18 
 
 
269 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  35.32 
 
 
264 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  36.71 
 
 
261 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  33.03 
 
 
289 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  28.84 
 
 
272 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  28.84 
 
 
272 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  28.84 
 
 
272 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  33.03 
 
 
267 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  29.92 
 
 
268 aa  99  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  36.84 
 
 
268 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  34.4 
 
 
271 aa  95.9  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  29.18 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  30.49 
 
 
272 aa  91.3  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  40.31 
 
 
280 aa  90.1  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  29.55 
 
 
261 aa  89.4  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  30.87 
 
 
272 aa  87.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  30.22 
 
 
285 aa  86.3  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  32.12 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  30 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  38.93 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  28.5 
 
 
279 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  29.48 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  29.95 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  28.37 
 
 
279 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  28.37 
 
 
279 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  28.37 
 
 
279 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  27.96 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2203  transglutaminase domain protein  37.78 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.424742  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  32.06 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  29.25 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  39.5 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>