More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2553 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
268 aa  538  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  80.9 
 
 
268 aa  447  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  52.43 
 
 
264 aa  247  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  48.88 
 
 
272 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  48.88 
 
 
272 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  48.88 
 
 
272 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  56.47 
 
 
263 aa  243  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  47.01 
 
 
267 aa  226  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  44.65 
 
 
289 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  44.78 
 
 
269 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  45.17 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  44.57 
 
 
279 aa  198  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  42.86 
 
 
281 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  45.75 
 
 
260 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  47.53 
 
 
257 aa  149  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  33.73 
 
 
282 aa  148  9e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  43.67 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  31.99 
 
 
286 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  34.96 
 
 
281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  38.31 
 
 
321 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  39.25 
 
 
327 aa  139  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  44.17 
 
 
286 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  44.17 
 
 
286 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  34.41 
 
 
298 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  41.85 
 
 
286 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  43.06 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  37.66 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  42.07 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  42.95 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  37.29 
 
 
285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  41.61 
 
 
286 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  31.66 
 
 
288 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  35.56 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  36 
 
 
291 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  40.35 
 
 
284 aa  125  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  38.02 
 
 
293 aa  122  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  36.41 
 
 
271 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  33.64 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  35.55 
 
 
367 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  29.55 
 
 
267 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  37.74 
 
 
266 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  30.3 
 
 
290 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  30.65 
 
 
295 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  36.77 
 
 
266 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  34.1 
 
 
280 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  36.08 
 
 
265 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  27.65 
 
 
310 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  28.62 
 
 
275 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  33.17 
 
 
264 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  38.27 
 
 
272 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  35.84 
 
 
273 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  31.96 
 
 
283 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  34.48 
 
 
282 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  29.92 
 
 
273 aa  99  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  31.88 
 
 
277 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  30.85 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  30.85 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  33.91 
 
 
292 aa  95.9  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  33.75 
 
 
290 aa  95.5  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  34.39 
 
 
269 aa  95.5  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  34.93 
 
 
276 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  35.29 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  31.22 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  31.28 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  32.37 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  30.93 
 
 
282 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  28.29 
 
 
279 aa  94  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  33.72 
 
 
283 aa  93.2  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  32 
 
 
294 aa  93.2  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  32.04 
 
 
270 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  34.93 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  36.18 
 
 
275 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  35.06 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  34.32 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  34.32 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  31.46 
 
 
280 aa  87  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  29.65 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  30.29 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  33.33 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  34.42 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  34.42 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  30.86 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  35.46 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  34.46 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  35.51 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  34.65 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  34.65 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  34.65 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  36.72 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  36.09 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  29.15 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  31.93 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  34.88 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  33.81 
 
 
280 aa  65.5  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  35.43 
 
 
283 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  33.94 
 
 
308 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  29.15 
 
 
266 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  29.06 
 
 
297 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  29.19 
 
 
318 aa  62.4  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>