279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3063 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 367 aa  753    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  65.17 
 
 		 321 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  63.16 
 
 		 327 aa  358  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  58.89 
 
 		 293 aa  330  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  52.11 
 
 		 285 aa  302  8.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  53.36 
 
 		 286 aa  286  5e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  46.07 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  44.04 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  40.66 
 
 		 282 aa  220  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  38.19 
 
 		 286 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  37.85 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  37.5 
 
 		 286 aa  203  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  37.15 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  44.53 
 
 		 284 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  43.56 
 
 		 298 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  42.22 
 
 		 281 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  37.2 
 
 		 286 aa  192  8e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  38.93 
 
 		 291 aa  187  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  40.75 
 
 		 257 aa  176  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  43.33 
 
 		 288 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  35.27 
 
 		 261 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  33.58 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  39.74 
 
 		 266 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  45.5 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  45.5 
 
 		 270 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  45.51 
 
 		 276 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  35.47 
 
 		 279 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  46.86 
 
 		 271 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  35.29 
 
 		 267 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  48.45 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  35.47 
 
 		 279 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  36.33 
 
 		 279 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  36.25 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  37.98 
 
 		 273 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  34.11 
 
 		 272 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  41.62 
 
 		 283 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  34.98 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  41.94 
 
 		 275 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  42.86 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  37.7 
 
 		 254 aa  143  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  42.86 
 
 		 282 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  33.73 
 
 		 258 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  40.44 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  44.91 
 
 		 270 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  34.38 
 
 		 276 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  34.33 
 
 		 264 aa  139  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  37.5 
 
 		 280 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  41.12 
 
 		 277 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  31.71 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  40.64 
 
 		 283 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  43.27 
 
 		 280 aa  136  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  42.24 
 
 		 276 aa  136  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  43.67 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  39.11 
 
 		 280 aa  134  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  42.86 
 
 		 268 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  33.2 
 
 		 273 aa  133  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  44.17 
 
 		 269 aa  133  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  33.85 
 
 		 272 aa  133  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  42.44 
 
 		 271 aa  133  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  34.24 
 
 		 265 aa  132  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  37.5 
 
 		 263 aa  129  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  37.95 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  41.77 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  40.8 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 275 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  35.55 
 
 		 268 aa  127  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  31.09 
 
 		 267 aa  125  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  40.76 
 
 		 294 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  39.38 
 
 		 279 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  38.54 
 
 		 264 aa  122  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  39.18 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  37.31 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  37.37 
 
 		 289 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  31.01 
 
 		 275 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  35.26 
 
 		 275 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  34.86 
 
 		 272 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  34.86 
 
 		 272 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  34.86 
 
 		 272 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  38.75 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  35.6 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  32.89 
 
 		 279 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  32.44 
 
 		 269 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  37.79 
 
 		 271 aa  97.8  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  30.28 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  34.01 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  30.99 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  30.99 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  30.99 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  38.26 
 
 		 281 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  28.67 
 
 		 279 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  33.67 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  27.63 
 
 		 285 aa  67  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  29.79 
 
 		 280 aa  67  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  28.76 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  33.64 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  32.74 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  27.97 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  27.89 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  27.89 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  31.67 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>