More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1038 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  100 
 
 
280 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  68.16 
 
 
292 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  61.34 
 
 
270 aa  351  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  62.78 
 
 
276 aa  347  9e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  60.59 
 
 
270 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  63.16 
 
 
269 aa  344  8e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  62.55 
 
 
280 aa  343  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  60.97 
 
 
290 aa  342  2.9999999999999997e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  60.51 
 
 
280 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  57.62 
 
 
295 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  58.43 
 
 
276 aa  324  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  55.35 
 
 
279 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  57.62 
 
 
282 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  54.68 
 
 
273 aa  320  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  55.81 
 
 
275 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  56.88 
 
 
283 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  55.6 
 
 
278 aa  318  7e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  56.55 
 
 
283 aa  317  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  55.27 
 
 
310 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  56.13 
 
 
275 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  56.62 
 
 
279 aa  315  6e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  55.43 
 
 
268 aa  311  6.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  53.93 
 
 
275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  54.28 
 
 
279 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  53.9 
 
 
279 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  54.15 
 
 
277 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  53.87 
 
 
272 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  52.81 
 
 
270 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  54.01 
 
 
282 aa  295  7e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  53.05 
 
 
267 aa  290  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  52.4 
 
 
294 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  51.53 
 
 
290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  52.06 
 
 
275 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  52.86 
 
 
294 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  52.43 
 
 
280 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  54.44 
 
 
272 aa  279  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  51.29 
 
 
271 aa  272  6e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  50.56 
 
 
267 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  44.7 
 
 
273 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  38.93 
 
 
288 aa  195  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  37.79 
 
 
271 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  37.11 
 
 
264 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  38.67 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  38.4 
 
 
285 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  42.47 
 
 
266 aa  170  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  46.77 
 
 
321 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  35.77 
 
 
276 aa  165  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  35 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  38.81 
 
 
265 aa  163  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  40.17 
 
 
298 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  41.63 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  34.07 
 
 
298 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  36.25 
 
 
286 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  40.91 
 
 
281 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  40.7 
 
 
293 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  34.38 
 
 
281 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  39.11 
 
 
291 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  38.39 
 
 
284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  32.55 
 
 
282 aa  139  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  32.83 
 
 
286 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  37.5 
 
 
367 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  34.51 
 
 
286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  39.57 
 
 
257 aa  128  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  34.12 
 
 
286 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  34.12 
 
 
286 aa  125  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  34.62 
 
 
254 aa  116  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  40.74 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  33.03 
 
 
268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  33.49 
 
 
264 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  34.1 
 
 
268 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  30.86 
 
 
289 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  32.71 
 
 
271 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  34.76 
 
 
258 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  34.5 
 
 
261 aa  97.8  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  35.62 
 
 
261 aa  97.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  37.5 
 
 
263 aa  95.9  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  32.69 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  37.97 
 
 
279 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  35.22 
 
 
269 aa  89  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  26.61 
 
 
272 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  34.51 
 
 
314 aa  86.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  26.61 
 
 
272 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  26.61 
 
 
272 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  30.47 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  29.88 
 
 
283 aa  82  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  29.36 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  37.39 
 
 
281 aa  79  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  27.06 
 
 
266 aa  79  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  29.18 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  36 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  36.84 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  31.16 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  27.01 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  31.61 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2203  transglutaminase domain protein  35.29 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.424742  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0855  transglutaminase domain protein  27.6 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21199  normal  0.166966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  36.57 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  38.33 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  27.06 
 
 
279 aa  68.9  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>