More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0804 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  100 
 
 
269 aa  542  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  62.45 
 
 
289 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  61.05 
 
 
272 aa  325  6e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  61.05 
 
 
272 aa  325  6e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  61.05 
 
 
272 aa  325  6e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  60.53 
 
 
267 aa  321  7e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  56.06 
 
 
279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  55.98 
 
 
263 aa  236  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  49.62 
 
 
264 aa  229  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  45.35 
 
 
268 aa  226  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  44.78 
 
 
268 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  46.1 
 
 
271 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  38.46 
 
 
281 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  38.66 
 
 
298 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  37.18 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  35.23 
 
 
284 aa  138  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  38.79 
 
 
286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  39.15 
 
 
286 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  38.03 
 
 
286 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  42.07 
 
 
260 aa  133  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  38.03 
 
 
286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  44.37 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  36.67 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  46.38 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  35.21 
 
 
288 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  45.07 
 
 
254 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  34.73 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  45 
 
 
286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  40.51 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  47.14 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  40.43 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
276 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  35.12 
 
 
327 aa  112  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  29.34 
 
 
260 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  34.02 
 
 
285 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  35.71 
 
 
266 aa  108  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  30.77 
 
 
321 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  34.18 
 
 
273 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  35.47 
 
 
286 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  35.43 
 
 
271 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  33.16 
 
 
264 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  34.9 
 
 
265 aa  99.8  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  32.44 
 
 
367 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  38.62 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  31.7 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  28.57 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  36.88 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  31.67 
 
 
273 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  37.27 
 
 
269 aa  92.8  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  35 
 
 
275 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  35.09 
 
 
276 aa  92  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  35.62 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  28.92 
 
 
280 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  35.62 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  33.33 
 
 
293 aa  89.7  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  29.17 
 
 
272 aa  89  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  30.65 
 
 
266 aa  89  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  35.22 
 
 
280 aa  89  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  36.81 
 
 
283 aa  88.6  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  34.39 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  34.39 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  35.12 
 
 
277 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  29.03 
 
 
280 aa  85.9  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  34.3 
 
 
292 aa  85.9  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  33.75 
 
 
279 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  30.33 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  29.44 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  33.02 
 
 
290 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  32.72 
 
 
267 aa  84  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  33.02 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  32.95 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  34.38 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  35.12 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  33.75 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  30.85 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  32.68 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  35.92 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  32.98 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  34.76 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  32.5 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  33.75 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  34.78 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  28.51 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  31.1 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  34.66 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  27.76 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  36.29 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  26.84 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  27.9 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  32.37 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  35.21 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  39.32 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  32 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  33.57 
 
 
265 aa  67  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  25.54 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2845  transglutaminase domain protein  32.85 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  30.27 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  37.5 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  30.27 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  35.07 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>