More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6594 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 295 aa  598  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  80.66 
 
 		 276 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  72.76 
 
 		 279 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  70.61 
 
 		 279 aa  421  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  70.25 
 
 		 279 aa  420  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  73.63 
 
 		 282 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  70.11 
 
 		 272 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  66.91 
 
 		 283 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  66.18 
 
 		 310 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  65.07 
 
 		 282 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  62.92 
 
 		 275 aa  364  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  64.66 
 
 		 269 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  62.27 
 
 		 275 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  62.87 
 
 		 280 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  63.1 
 
 		 277 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  62.69 
 
 		 268 aa  360  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  61.8 
 
 		 270 aa  358  9e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  58.36 
 
 		 273 aa  345  4e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  61.42 
 
 		 267 aa  344  8e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  57.19 
 
 		 279 aa  341  8e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  59.85 
 
 		 278 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  60 
 
 		 275 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  58.97 
 
 		 275 aa  338  5e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  57.62 
 
 		 280 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  56 
 
 		 283 aa  323  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  58.48 
 
 		 280 aa  322  3e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  55.06 
 
 		 267 aa  322  6e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  54.12 
 
 		 290 aa  318  7e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  57.93 
 
 		 271 aa  317  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  53.31 
 
 		 290 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  57.2 
 
 		 294 aa  316  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  54.87 
 
 		 280 aa  314  9e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  55.19 
 
 		 292 aa  311  6.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  56.99 
 
 		 272 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  55.02 
 
 		 270 aa  300  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  54.65 
 
 		 270 aa  298  7e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  54.1 
 
 		 276 aa  298  8e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  50.73 
 
 		 294 aa  286  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  41.98 
 
 		 271 aa  215  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  42.65 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  41.73 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  41.13 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  39.64 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  38.58 
 
 		 265 aa  185  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  34.83 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  41.57 
 
 		 266 aa  183  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  38.43 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  40 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  36.16 
 
 		 298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  38.04 
 
 		 286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  32.85 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  35.82 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  34.96 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  34.63 
 
 		 286 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  34.96 
 
 		 286 aa  156  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  41.13 
 
 		 281 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  42.2 
 
 		 291 aa  155  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  41.07 
 
 		 327 aa  155  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  41.07 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  38.46 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  34.38 
 
 		 285 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  37.16 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  42.37 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  32.75 
 
 		 286 aa  142  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  40.44 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  42.29 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  34.42 
 
 		 264 aa  122  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  34.29 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  32.68 
 
 		 260 aa  112  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  34.83 
 
 		 261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  32.97 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  29.37 
 
 		 289 aa  106  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  30.65 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  39.01 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  30.3 
 
 		 258 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  30.43 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  30.43 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  30.43 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  38.67 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  36.11 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  32.4 
 
 		 279 aa  95.5  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  36.88 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  29.55 
 
 		 267 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  30.83 
 
 		 316 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  34.75 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  28.14 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  29.44 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  35.96 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  40.86 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  26.84 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  31.6 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  34.21 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  32.84 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  37.07 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  34.52 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  25.57 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  28.22 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  34.2 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  29.19 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  38 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>