More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3823 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 290 aa  605  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  72.36 
 
 		 280 aa  427  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  72.04 
 
 		 280 aa  420  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  60.97 
 
 		 280 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  58.84 
 
 		 292 aa  338  9e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  56.13 
 
 		 282 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  56.13 
 
 		 277 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  54.12 
 
 		 295 aa  318  6e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  55.43 
 
 		 310 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  55.02 
 
 		 283 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  55.81 
 
 		 268 aa  312  4.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  55.43 
 
 		 275 aa  311  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  51.61 
 
 		 279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  52.96 
 
 		 273 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  52.4 
 
 		 275 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  51.25 
 
 		 279 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  51.3 
 
 		 275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  52 
 
 		 283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  51.61 
 
 		 279 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  52.42 
 
 		 278 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  55.97 
 
 		 276 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  52.03 
 
 		 272 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  51.8 
 
 		 279 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  55.64 
 
 		 269 aa  301  7.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  53.93 
 
 		 270 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  53.51 
 
 		 276 aa  300  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  53.48 
 
 		 275 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  55.02 
 
 		 280 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  51.09 
 
 		 282 aa  292  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  53.18 
 
 		 267 aa  288  8e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  52.04 
 
 		 270 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  51.67 
 
 		 270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  52.57 
 
 		 272 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  52.77 
 
 		 271 aa  280  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  48.69 
 
 		 267 aa  275  7e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  48.69 
 
 		 290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  49.25 
 
 		 294 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  50.18 
 
 		 294 aa  265  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  41.51 
 
 		 273 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  36.98 
 
 		 288 aa  182  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  36.23 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  44.44 
 
 		 298 aa  162  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  35.82 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  37.79 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  35.55 
 
 		 266 aa  158  9e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  34.94 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  36.68 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  34.35 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  39.62 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  34.94 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  41.29 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  32.28 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  32.47 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  40 
 
 		 321 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  34.96 
 
 		 281 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  34.65 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  30.6 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  31.8 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  37.13 
 
 		 293 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  32.81 
 
 		 286 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  29.67 
 
 		 286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  29.67 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  29.3 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  32.3 
 
 		 286 aa  125  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  36.67 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  39.18 
 
 		 367 aa  115  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  40.61 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  29.73 
 
 		 260 aa  105  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  27.47 
 
 		 261 aa  99.8  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  27.73 
 
 		 264 aa  99  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  33.54 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  32.24 
 
 		 271 aa  97.1  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  33.75 
 
 		 268 aa  95.5  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  33.33 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  35.62 
 
 		 268 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  35.29 
 
 		 263 aa  90.1  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  31.28 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  32.45 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  28.57 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  32.5 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  39.45 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  26.16 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  26.16 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  26.16 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  29.63 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  27.4 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  33.09 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  35.29 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  27.51 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  26.94 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  29.56 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  27.67 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  30.26 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  34.45 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  27.76 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  28.44 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  27.6 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  29.22 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  41.3 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  36.75 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>