More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3478 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 294 aa  600  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  60.22 
 
 		 275 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  60.45 
 
 		 275 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  59.35 
 
 		 283 aa  353  1e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  60.3 
 
 		 278 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  59.55 
 
 		 279 aa  351  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  56.55 
 
 		 273 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  54.31 
 
 		 270 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  54.48 
 
 		 275 aa  302  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  54.2 
 
 		 267 aa  301  9e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  54.1 
 
 		 268 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  53.44 
 
 		 290 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  52.4 
 
 		 280 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  53.18 
 
 		 276 aa  290  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  50.95 
 
 		 292 aa  288  5.0000000000000004e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  50.73 
 
 		 295 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  51.42 
 
 		 280 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  48.31 
 
 		 279 aa  276  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  51.31 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  52.94 
 
 		 294 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  51.49 
 
 		 275 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  51.31 
 
 		 270 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  48.69 
 
 		 279 aa  271  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  48.19 
 
 		 282 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  51.12 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  51.91 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  47.97 
 
 		 272 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  50.38 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  48.31 
 
 		 279 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  49.25 
 
 		 290 aa  269  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  50.37 
 
 		 280 aa  268  8.999999999999999e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  48.09 
 
 		 310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  49.43 
 
 		 283 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  48.47 
 
 		 277 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  47.78 
 
 		 280 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  48.34 
 
 		 271 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  46.86 
 
 		 282 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  47.97 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  41.73 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  38.11 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  35.21 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  38.67 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  41.33 
 
 		 260 aa  169  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  35.52 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  36.22 
 
 		 264 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  40.78 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  34.09 
 
 		 266 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  36.22 
 
 		 265 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  37.79 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  37.84 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  34.38 
 
 		 281 aa  148  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  35.87 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  33.46 
 
 		 298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  39.2 
 
 		 281 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  33.46 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  35.45 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  38.69 
 
 		 284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  29.89 
 
 		 282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  32.98 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  32.03 
 
 		 286 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  31.48 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  30.93 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  31.16 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  34.22 
 
 		 257 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  30.74 
 
 		 286 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  40.76 
 
 		 367 aa  118  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  30.8 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  33.17 
 
 		 254 aa  105  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  34.32 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  27.61 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  29.32 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  27.14 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  35.54 
 
 		 268 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  32.13 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  34.42 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  38.51 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  30.66 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  29.02 
 
 		 272 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  28.46 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  28.52 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  37.93 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  37.7 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  36.81 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  36.81 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  36.81 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  31.94 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  33.64 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  30.07 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  36.02 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0855  transglutaminase domain protein  33.06 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21199  normal  0.166966 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  31.53 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  34.66 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  36.02 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  28.51 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  35.4 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  35.4 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  35.4 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  35.4 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  35.4 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  43.62 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>