More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3180 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  100 
 
 
270 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  98.89 
 
 
270 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  77.82 
 
 
276 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  61.34 
 
 
280 aa  351  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  59.63 
 
 
292 aa  338  4e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  56.02 
 
 
269 aa  302  3.0000000000000004e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  54.65 
 
 
295 aa  298  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  53.51 
 
 
276 aa  294  9e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  55.02 
 
 
280 aa  293  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  53.33 
 
 
280 aa  293  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  52.4 
 
 
278 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  53.16 
 
 
279 aa  290  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  50.92 
 
 
279 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  54.1 
 
 
268 aa  289  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  53.16 
 
 
273 aa  288  6e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  51.66 
 
 
275 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  52.22 
 
 
275 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  52.04 
 
 
290 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  51.3 
 
 
279 aa  285  7e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  53.87 
 
 
282 aa  284  8e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  50.93 
 
 
279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  52.38 
 
 
282 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  53.18 
 
 
310 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  53.16 
 
 
283 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  49.44 
 
 
275 aa  278  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  49.81 
 
 
267 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  52.19 
 
 
294 aa  276  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  49.82 
 
 
283 aa  276  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  51.31 
 
 
294 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  48.69 
 
 
270 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  51.67 
 
 
277 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  50.92 
 
 
272 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  52.21 
 
 
272 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  52.4 
 
 
271 aa  268  7e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  48.69 
 
 
290 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  51.3 
 
 
280 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  50.56 
 
 
267 aa  264  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  50.56 
 
 
275 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  45.49 
 
 
273 aa  221  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  39.26 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  38.64 
 
 
288 aa  185  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  39.16 
 
 
266 aa  178  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  42.59 
 
 
260 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  38.2 
 
 
265 aa  175  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  39.61 
 
 
266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  38.89 
 
 
276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  34.44 
 
 
264 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  36.68 
 
 
298 aa  159  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  42.99 
 
 
327 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  35.93 
 
 
298 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  36.94 
 
 
285 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  43.12 
 
 
321 aa  155  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  35.77 
 
 
286 aa  149  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  40.3 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  32.97 
 
 
282 aa  145  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  45.5 
 
 
367 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  40.57 
 
 
291 aa  143  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  39.52 
 
 
281 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  39.6 
 
 
284 aa  139  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  44.17 
 
 
293 aa  138  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  33.45 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  33.7 
 
 
286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  38.89 
 
 
286 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  32.96 
 
 
286 aa  125  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  32.96 
 
 
286 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  41.71 
 
 
257 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  37.25 
 
 
254 aa  115  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  37.11 
 
 
260 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  31.34 
 
 
289 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  37.87 
 
 
258 aa  99.8  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  34.48 
 
 
261 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  33.89 
 
 
261 aa  97.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  34.59 
 
 
268 aa  92  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  38.51 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  38.51 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  38.51 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  33.16 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  30.27 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  30.77 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  34.32 
 
 
268 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  34.39 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  34.23 
 
 
279 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  37.58 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  31.39 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  27.98 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  28.57 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0855  transglutaminase domain protein  31.31 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21199  normal  0.166966 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  28.37 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  39.13 
 
 
281 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  30.05 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  30.21 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  35.58 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  29.44 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  30.26 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  30.26 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  30.26 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2845  transglutaminase domain protein  31.41 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  37.23 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  39.81 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>