More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1549 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
268 aa  557  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  62.69 
 
 
295 aa  360  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  64.04 
 
 
275 aa  358  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  62.31 
 
 
273 aa  357  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  64.04 
 
 
280 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  61.94 
 
 
279 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  59.18 
 
 
275 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  61.8 
 
 
276 aa  351  8.999999999999999e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  61.57 
 
 
279 aa  350  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  61.62 
 
 
272 aa  348  5e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  61.42 
 
 
310 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  61.8 
 
 
283 aa  346  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  63.53 
 
 
269 aa  346  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  63.3 
 
 
267 aa  345  5e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  60.45 
 
 
279 aa  343  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  58.05 
 
 
279 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  58.05 
 
 
275 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  59.55 
 
 
282 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  60.67 
 
 
277 aa  335  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  56.93 
 
 
275 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  56.55 
 
 
278 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  56.55 
 
 
270 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  59.41 
 
 
282 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  57.3 
 
 
280 aa  318  7e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  57.63 
 
 
292 aa  317  9e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  57.68 
 
 
280 aa  312  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  55.81 
 
 
290 aa  312  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  55.43 
 
 
280 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  55.06 
 
 
283 aa  310  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  53.93 
 
 
267 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  56.83 
 
 
271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  53.93 
 
 
290 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  57.04 
 
 
294 aa  301  7.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  54.1 
 
 
294 aa  300  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  53.33 
 
 
272 aa  290  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  54.1 
 
 
270 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  54.1 
 
 
270 aa  289  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  53.56 
 
 
276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  43.07 
 
 
273 aa  224  9e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  38.64 
 
 
271 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  37.35 
 
 
276 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  36.26 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  37.5 
 
 
260 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  42.04 
 
 
298 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  34.63 
 
 
264 aa  166  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  36.78 
 
 
266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  35.74 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  36.22 
 
 
265 aa  163  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  49.07 
 
 
321 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  43.1 
 
 
293 aa  152  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  39.15 
 
 
327 aa  152  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  45.03 
 
 
291 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  37.23 
 
 
281 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  32.83 
 
 
282 aa  143  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  33.62 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  35.8 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  35.93 
 
 
284 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  31.64 
 
 
298 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  31.85 
 
 
286 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  39.77 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  42.86 
 
 
367 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  41.1 
 
 
286 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  39.2 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  39.2 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  33.59 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  34.56 
 
 
285 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  33.78 
 
 
271 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  34.16 
 
 
254 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  30.28 
 
 
289 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  31.8 
 
 
264 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  32.16 
 
 
260 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  33.79 
 
 
263 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  34.62 
 
 
258 aa  99  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  28.85 
 
 
261 aa  97.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  33.52 
 
 
261 aa  94  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  27.38 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  34.93 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  26.62 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  26.62 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  26.62 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  32.95 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  32.45 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  29.52 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  27.12 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  28.72 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  31.39 
 
 
280 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  29.23 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  27.94 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  28.44 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  28.67 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  26.15 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  26.64 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  26.56 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  27.59 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  28.05 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  25.66 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  35.34 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  40.65 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  28.44 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.80946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>