More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1476 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
265 aa  550  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  59.07 
 
 
264 aa  333  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  56.65 
 
 
266 aa  315  6e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  54.79 
 
 
271 aa  295  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  55.1 
 
 
288 aa  291  9e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  50.19 
 
 
260 aa  246  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  47.29 
 
 
276 aa  245  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  42.7 
 
 
266 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  41.42 
 
 
283 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  43.08 
 
 
310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  41.26 
 
 
282 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  38.2 
 
 
276 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  38.58 
 
 
295 aa  185  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  39.78 
 
 
276 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  38.81 
 
 
273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  37.92 
 
 
277 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  40.38 
 
 
290 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  39.62 
 
 
267 aa  178  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  37.55 
 
 
270 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  38.2 
 
 
270 aa  175  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  38.2 
 
 
270 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  37.41 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  37.15 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  39.02 
 
 
279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  35.96 
 
 
279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  36.33 
 
 
292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  39.02 
 
 
279 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  39.39 
 
 
298 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  37 
 
 
273 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  39.06 
 
 
283 aa  169  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  35.51 
 
 
282 aa  168  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  36.63 
 
 
272 aa  168  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  38.52 
 
 
281 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  38.46 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  38.81 
 
 
280 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  36.22 
 
 
268 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  36.22 
 
 
294 aa  162  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  35.43 
 
 
279 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  36.22 
 
 
275 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  35.83 
 
 
275 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  35.43 
 
 
278 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  36.64 
 
 
284 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  36.99 
 
 
327 aa  152  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  34.83 
 
 
280 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  38.46 
 
 
286 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  37.35 
 
 
267 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  35.89 
 
 
282 aa  149  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  36.68 
 
 
291 aa  149  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  35.77 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  35.06 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  33.46 
 
 
280 aa  145  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  34.08 
 
 
275 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  34.32 
 
 
271 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  33.47 
 
 
285 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  32.21 
 
 
280 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  32.7 
 
 
286 aa  143  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  33.71 
 
 
286 aa  142  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  33.59 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  32.28 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  32.32 
 
 
286 aa  139  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  35.1 
 
 
286 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  32.7 
 
 
286 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  34.29 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  34.16 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  34.92 
 
 
367 aa  126  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  30.15 
 
 
261 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  34.29 
 
 
257 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  37.43 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  30.5 
 
 
264 aa  108  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  33.04 
 
 
271 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  40.82 
 
 
263 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  32.69 
 
 
289 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  38.31 
 
 
279 aa  105  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  29.27 
 
 
260 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  36.08 
 
 
268 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  34.9 
 
 
269 aa  99.8  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  32.9 
 
 
280 aa  99.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  28.84 
 
 
261 aa  99  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  37.01 
 
 
272 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  37.01 
 
 
272 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  37.01 
 
 
272 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  36.08 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  32.77 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  35.54 
 
 
258 aa  96.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  30.2 
 
 
267 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  31.22 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  29.12 
 
 
326 aa  92.4  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  28.62 
 
 
272 aa  91.3  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  31.58 
 
 
266 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  27.34 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  30.8 
 
 
273 aa  89.4  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  30.86 
 
 
266 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  30.28 
 
 
266 aa  87  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  31.42 
 
 
272 aa  86.3  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  27.7 
 
 
272 aa  86.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  28.57 
 
 
279 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  28.57 
 
 
279 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  28.57 
 
 
279 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  29.15 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  30.77 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>