More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0573 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  100 
 
 
269 aa  551  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  66.54 
 
 
276 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  64.66 
 
 
295 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  64.02 
 
 
279 aa  360  9e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  63.64 
 
 
279 aa  359  3e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  62.41 
 
 
279 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  61.28 
 
 
282 aa  348  7e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  63.53 
 
 
268 aa  346  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  60.9 
 
 
283 aa  344  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  63.16 
 
 
280 aa  344  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  61.85 
 
 
282 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  60.98 
 
 
310 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  61.48 
 
 
272 aa  339  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  59.48 
 
 
273 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  61.65 
 
 
277 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  60.22 
 
 
294 aa  322  4e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  56.02 
 
 
275 aa  321  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  59.02 
 
 
267 aa  320  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  57.84 
 
 
270 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  57.89 
 
 
275 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  56.77 
 
 
280 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  58.27 
 
 
292 aa  313  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  58.27 
 
 
280 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  54.51 
 
 
275 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  56.02 
 
 
275 aa  308  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  56.39 
 
 
270 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  54.89 
 
 
278 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  55.26 
 
 
283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  56.02 
 
 
270 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  55.64 
 
 
290 aa  301  7.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  57.99 
 
 
271 aa  299  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  54.96 
 
 
267 aa  299  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  54.14 
 
 
279 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  56.02 
 
 
280 aa  298  7e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  55.76 
 
 
276 aa  298  8e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  54.58 
 
 
290 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  57.62 
 
 
272 aa  297  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  51.91 
 
 
294 aa  270  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  43.94 
 
 
273 aa  218  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  39.31 
 
 
271 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  37.4 
 
 
288 aa  186  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  39.53 
 
 
266 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  36.67 
 
 
260 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  37.41 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  33.85 
 
 
276 aa  168  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  34.57 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  37.17 
 
 
266 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  39.6 
 
 
298 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  38.58 
 
 
291 aa  152  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  34.51 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  41.31 
 
 
284 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  42.5 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  43.07 
 
 
321 aa  145  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  33.47 
 
 
282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  35.18 
 
 
285 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  35.04 
 
 
286 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  40.38 
 
 
327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  42.94 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  34.25 
 
 
281 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  32.2 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  44.17 
 
 
367 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  31.33 
 
 
286 aa  125  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  30.8 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  30.86 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  32.95 
 
 
286 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  37.22 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  33.72 
 
 
264 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  33.05 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  32.93 
 
 
289 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  41.92 
 
 
263 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  35.21 
 
 
271 aa  105  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  36.84 
 
 
258 aa  102  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  27.82 
 
 
260 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  35.33 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  30.38 
 
 
267 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  29.23 
 
 
272 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  29.23 
 
 
272 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  29.23 
 
 
272 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  34.39 
 
 
268 aa  95.5  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  37.27 
 
 
269 aa  92.8  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  28.84 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  32.3 
 
 
261 aa  86.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  29.37 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  33.2 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  30.37 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  40.35 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  37.29 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  29.68 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  36.97 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  35.65 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  41.25 
 
 
264 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  36.75 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  34.19 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  29.36 
 
 
279 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  29.36 
 
 
279 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  29.36 
 
 
279 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  29.56 
 
 
266 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2638  transglutaminase-like  32.56 
 
 
299 aa  63.5  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.947389  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  28.27 
 
 
266 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  36.17 
 
 
266 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>