More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2648 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  100 
 
 
286 aa  585  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  93.33 
 
 
286 aa  551  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  92.98 
 
 
286 aa  548  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  77.19 
 
 
286 aa  461  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  63.16 
 
 
286 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  57.14 
 
 
298 aa  309  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  48.85 
 
 
281 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  45.21 
 
 
284 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  43.89 
 
 
327 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  42.54 
 
 
282 aa  223  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  44.49 
 
 
298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  44.96 
 
 
281 aa  221  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  42.35 
 
 
293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  46.3 
 
 
291 aa  215  8e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  39.25 
 
 
321 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  42.19 
 
 
286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  37.85 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  40.55 
 
 
285 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  37.78 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  40 
 
 
261 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  40.08 
 
 
257 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  38.15 
 
 
260 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  36.99 
 
 
258 aa  166  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  36.67 
 
 
254 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  35.82 
 
 
295 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  45.56 
 
 
276 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  35.77 
 
 
271 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  35.51 
 
 
260 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  34.36 
 
 
261 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  34.34 
 
 
266 aa  149  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  35.63 
 
 
289 aa  149  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  35.34 
 
 
290 aa  148  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  36.54 
 
 
267 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  33.71 
 
 
276 aa  146  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  33.21 
 
 
275 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  38.27 
 
 
267 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  32.44 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  47.47 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  35.85 
 
 
280 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  40.12 
 
 
282 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  46.77 
 
 
263 aa  139  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  32.7 
 
 
266 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  32.7 
 
 
265 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
264 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  32.25 
 
 
279 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  32.81 
 
 
280 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  41.85 
 
 
268 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  36.21 
 
 
272 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  36.21 
 
 
272 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  35.19 
 
 
283 aa  135  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  36.21 
 
 
272 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  31.7 
 
 
277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  40.58 
 
 
268 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  34.39 
 
 
273 aa  135  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  33.46 
 
 
272 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  31.85 
 
 
268 aa  135  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  32.09 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  31.39 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  30.18 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  38.03 
 
 
269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  33.7 
 
 
271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  31.02 
 
 
279 aa  132  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  32.2 
 
 
310 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  31.09 
 
 
270 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  34.51 
 
 
280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  33.7 
 
 
270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  29.67 
 
 
290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  36.96 
 
 
279 aa  129  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  34.06 
 
 
270 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  31.18 
 
 
267 aa  129  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  32.2 
 
 
269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  33.7 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  31.48 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  32 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  31.76 
 
 
280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  31.82 
 
 
292 aa  125  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  31.01 
 
 
294 aa  125  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  33.1 
 
 
276 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  29.18 
 
 
282 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  30.88 
 
 
275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  41.77 
 
 
271 aa  116  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  30.74 
 
 
278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  30.14 
 
 
275 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  31.91 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  36.62 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  24.38 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  24.38 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  24.38 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  32.94 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  33.82 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  36 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  39.34 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  32.67 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  34.23 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  37.09 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  37.07 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  37.9 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  32.14 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  38.71 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  32.57 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>