271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2448 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
282 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  78.23 
 
 
272 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  73.14 
 
 
279 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  73.63 
 
 
295 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  68.2 
 
 
279 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  68.55 
 
 
279 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  69.71 
 
 
276 aa  391  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  65.45 
 
 
283 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  65.82 
 
 
310 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  65.57 
 
 
282 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  63.12 
 
 
277 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  60.81 
 
 
280 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  61.99 
 
 
267 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  61.85 
 
 
269 aa  342  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  60.81 
 
 
275 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  59.41 
 
 
268 aa  327  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  56.57 
 
 
275 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  56.93 
 
 
270 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  54.18 
 
 
273 aa  311  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  53.41 
 
 
278 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  56.52 
 
 
280 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  53.62 
 
 
275 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  56.73 
 
 
271 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  54.01 
 
 
275 aa  301  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  56.41 
 
 
280 aa  299  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  50.71 
 
 
279 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  55.11 
 
 
294 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  54.01 
 
 
280 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  53.68 
 
 
292 aa  294  9e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  54.35 
 
 
272 aa  292  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  51.09 
 
 
290 aa  292  4e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  54.24 
 
 
276 aa  292  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  52.92 
 
 
270 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  49.82 
 
 
283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  52.38 
 
 
270 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  47.23 
 
 
267 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  46.49 
 
 
290 aa  269  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  46.86 
 
 
294 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  51.33 
 
 
273 aa  215  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  39.1 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  39.71 
 
 
288 aa  195  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  36.54 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  36.4 
 
 
266 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  39.46 
 
 
276 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  37.77 
 
 
266 aa  169  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  35.51 
 
 
265 aa  168  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  33.94 
 
 
264 aa  159  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  38.06 
 
 
281 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  38.52 
 
 
321 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  36.92 
 
 
284 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  38.79 
 
 
298 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  37.87 
 
 
327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  32.2 
 
 
282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  38.16 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  33.72 
 
 
286 aa  135  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
298 aa  132  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  34.21 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  41.07 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  30.92 
 
 
285 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  29.43 
 
 
286 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  29.43 
 
 
286 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  37.95 
 
 
367 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  29.18 
 
 
286 aa  122  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  38.4 
 
 
257 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  32.18 
 
 
286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  35.59 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  34.18 
 
 
254 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  35.59 
 
 
261 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  32.4 
 
 
264 aa  99  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  38.65 
 
 
260 aa  96.3  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  30.93 
 
 
268 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  31.68 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  35.9 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  33.91 
 
 
271 aa  90.5  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  36.67 
 
 
263 aa  86.3  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  32.95 
 
 
258 aa  86.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  28.63 
 
 
289 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  28.24 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  28.24 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  28.24 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  27.99 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  28.18 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  28.51 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  32.37 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  29.61 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  31.2 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  31.69 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  34.45 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  27.68 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  39.18 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  27.03 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  39.84 
 
 
293 aa  63.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  24.88 
 
 
272 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  33.81 
 
 
326 aa  62.4  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  36.07 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  24.42 
 
 
272 aa  62  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  40.43 
 
 
288 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2638  transglutaminase-like  30 
 
 
299 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.947389  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2203  transglutaminase domain protein  42.86 
 
 
279 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.424742  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  29.75 
 
 
294 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>