More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1280 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  100 
 
 		 278 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  93.53 
 
 		 275 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  91.54 
 
 		 275 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  82.91 
 
 		 279 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  66.17 
 
 		 273 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  61.76 
 
 		 283 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  60.3 
 
 		 294 aa  353  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  59.85 
 
 		 295 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  60.3 
 
 		 290 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  59.18 
 
 		 267 aa  339  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  56.55 
 
 		 268 aa  332  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  57.09 
 
 		 270 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  54.71 
 
 		 276 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  55.84 
 
 		 292 aa  322  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  56.09 
 
 		 272 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  54.18 
 
 		 275 aa  318  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  55.72 
 
 		 275 aa  318  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  55.6 
 
 		 280 aa  318  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  55.35 
 
 		 280 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  53.41 
 
 		 282 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  55.43 
 
 		 267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  53.51 
 
 		 282 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  54.89 
 
 		 269 aa  303  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  52.42 
 
 		 310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  52.42 
 
 		 290 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  51.66 
 
 		 279 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  51.67 
 
 		 283 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  50.56 
 
 		 279 aa  295  6e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  53.07 
 
 		 294 aa  294  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  54.65 
 
 		 280 aa  293  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  50.19 
 
 		 279 aa  293  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  51.11 
 
 		 280 aa  292  5e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  50.56 
 
 		 277 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  52.4 
 
 		 270 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  52.03 
 
 		 270 aa  288  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  51.48 
 
 		 271 aa  286  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  52.59 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  52.06 
 
 		 276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  43.45 
 
 		 273 aa  218  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  38.11 
 
 		 271 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  36.98 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  39.06 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  36.73 
 
 		 276 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  36.71 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  37.13 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  35.43 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  33.21 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  33.96 
 
 		 264 aa  146  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  33.72 
 
 		 281 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  35.34 
 
 		 291 aa  142  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  33.21 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  35.02 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  33.09 
 
 		 298 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  34.77 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  45 
 
 		 321 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  34.22 
 
 		 282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  34.63 
 
 		 286 aa  135  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  34.85 
 
 		 257 aa  128  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  33.07 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  38.89 
 
 		 327 aa  125  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  34.74 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  30.74 
 
 		 286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  30.48 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  30.48 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  38.75 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  36.09 
 
 		 286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  35.5 
 
 		 254 aa  99.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  36.97 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  28.02 
 
 		 260 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  34.32 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  31.98 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  32.43 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  29.24 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  35.06 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  28.81 
 
 		 264 aa  85.5  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  37.16 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  29.72 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  30.77 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  29.25 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  28.77 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  39.17 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  34.76 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  28.57 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  27.11 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  37.5 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  35.34 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  26.62 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  37.07 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  28.77 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  40.3 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  29.8 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  27.67 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  27.42 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  29.67 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  27.42 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  29.67 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  29.67 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  27.42 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  35.43 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  26.58 
 
 		 330 aa  72  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>