More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2611 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 279 aa  570  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  99.28 
 
 		 279 aa  566  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  86.38 
 
 		 279 aa  507  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  70.25 
 
 		 295 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  68.2 
 
 		 282 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  68.63 
 
 		 272 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  67.65 
 
 		 276 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  66.91 
 
 		 282 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  64.31 
 
 		 283 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  63.24 
 
 		 310 aa  367  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  64.42 
 
 		 277 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  63.64 
 
 		 269 aa  359  3e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  61.57 
 
 		 268 aa  350  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  61.05 
 
 		 275 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  59.27 
 
 		 275 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  60.61 
 
 		 267 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  59.18 
 
 		 280 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  58.05 
 
 		 270 aa  331  9e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  54.58 
 
 		 273 aa  322  4e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  53.82 
 
 		 283 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  54.51 
 
 		 280 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  54.15 
 
 		 280 aa  311  5.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  52.16 
 
 		 279 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  51.25 
 
 		 290 aa  305  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  56.78 
 
 		 271 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  53.9 
 
 		 280 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  52.35 
 
 		 292 aa  301  9e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  54.81 
 
 		 294 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  51.31 
 
 		 267 aa  299  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  52.04 
 
 		 275 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  51.69 
 
 		 290 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  50.19 
 
 		 278 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  50.19 
 
 		 275 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  50.93 
 
 		 270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  51.85 
 
 		 272 aa  282  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  50.56 
 
 		 270 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  49.44 
 
 		 276 aa  278  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  48.31 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  49.29 
 
 		 273 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  40.07 
 
 		 271 aa  205  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  40.45 
 
 		 288 aa  199  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  41.78 
 
 		 276 aa  192  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  37.74 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  39.61 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  36.82 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  39.02 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  34.9 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  43.17 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  39.74 
 
 		 327 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  40.57 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  38.19 
 
 		 284 aa  158  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  37.77 
 
 		 298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  42.06 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  37.01 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  42.93 
 
 		 293 aa  152  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  33.09 
 
 		 282 aa  149  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  35.47 
 
 		 367 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  36.94 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  34.98 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  31.39 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  37.57 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  37.57 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  35.17 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  34.19 
 
 		 285 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  37.36 
 
 		 286 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  39.66 
 
 		 257 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  35.47 
 
 		 254 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  32.59 
 
 		 264 aa  105  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  32.3 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  35.75 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  34.07 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  30.86 
 
 		 258 aa  99.4  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  29.22 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  29.22 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  29.22 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  29.67 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  30.85 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  33.76 
 
 		 263 aa  96.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  33.93 
 
 		 268 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  34.88 
 
 		 267 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  35.62 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  33.92 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  37.72 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  32.02 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2638  transglutaminase-like  29.76 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.947389  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  26.98 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  28.49 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  30.22 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  32.35 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  27.08 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  26.89 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2266  transglutaminase-like  33.33 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  26.89 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  26.89 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  26.64 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  27.31 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  25.87 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  32.2 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  27.8 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>