279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0968 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  100 
 
 
270 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  80 
 
 
275 aa  455  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  61.8 
 
 
295 aa  358  7e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  58.8 
 
 
282 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  58.21 
 
 
310 aa  343  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  58.58 
 
 
283 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  60.3 
 
 
276 aa  341  7e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  58.05 
 
 
273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  58.43 
 
 
277 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  59.18 
 
 
279 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  57.46 
 
 
279 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  58.43 
 
 
279 aa  332  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  56.09 
 
 
272 aa  332  5e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  58.05 
 
 
279 aa  331  9e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  57.09 
 
 
278 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  56.55 
 
 
268 aa  328  6e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  57.68 
 
 
275 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  56.93 
 
 
282 aa  325  5e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  56.55 
 
 
280 aa  322  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  56.93 
 
 
275 aa  321  7e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  57.84 
 
 
269 aa  319  3e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  55.97 
 
 
283 aa  319  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  55.43 
 
 
275 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  55.81 
 
 
267 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  53.56 
 
 
267 aa  308  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  56.18 
 
 
280 aa  307  9e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  52.81 
 
 
290 aa  305  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  54.31 
 
 
294 aa  305  7e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  53.93 
 
 
290 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  54.07 
 
 
294 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  54.68 
 
 
280 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  52.81 
 
 
280 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  52.29 
 
 
292 aa  290  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  52.59 
 
 
271 aa  290  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  50.56 
 
 
276 aa  285  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  50.37 
 
 
272 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  48.52 
 
 
270 aa  271  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  48.69 
 
 
270 aa  270  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  44.94 
 
 
273 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  39.63 
 
 
271 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  43.35 
 
 
260 aa  203  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  38.93 
 
 
288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  42.31 
 
 
266 aa  194  9e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  38.34 
 
 
264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  36.76 
 
 
276 aa  182  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  37.55 
 
 
265 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  40 
 
 
281 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  32.44 
 
 
266 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  38.34 
 
 
298 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  38.72 
 
 
284 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  38.49 
 
 
291 aa  152  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  36.86 
 
 
327 aa  148  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  35.27 
 
 
285 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  34.19 
 
 
298 aa  145  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  33.98 
 
 
282 aa  146  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  35.77 
 
 
321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  33.46 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  39.07 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  32.81 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  44.91 
 
 
367 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  32.17 
 
 
286 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  31.09 
 
 
286 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  31.91 
 
 
286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  31.91 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  33.33 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  31.03 
 
 
286 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  40.12 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  29.88 
 
 
289 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  35.71 
 
 
271 aa  106  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  27.17 
 
 
261 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  27.65 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  38.62 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  37.58 
 
 
272 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  37.58 
 
 
272 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  37.58 
 
 
272 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  31.34 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  31.52 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  35.37 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  32.04 
 
 
268 aa  92.4  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  30.46 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  31.25 
 
 
261 aa  89.4  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  35.26 
 
 
263 aa  89.7  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  31.33 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  31.11 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  35.57 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  35.57 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  35.57 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  30.24 
 
 
280 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  27.21 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  35.2 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  32.28 
 
 
316 aa  65.5  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  30.46 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  38.33 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  32.67 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  38.89 
 
 
264 aa  62  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  31.82 
 
 
314 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  29.87 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  34.69 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  26.73 
 
 
294 aa  60.1  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  33.53 
 
 
280 aa  59.7  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>