More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6778 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  100 
 
 		 275 aa  570  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  80 
 
 		 270 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  62.92 
 
 		 295 aa  364  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  62.55 
 
 		 279 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  61.82 
 
 		 276 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  61.8 
 
 		 279 aa  353  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  59.18 
 
 		 268 aa  352  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  61.05 
 
 		 279 aa  350  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  57.68 
 
 		 282 aa  348  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  59.33 
 
 		 283 aa  348  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  58.43 
 
 		 273 aa  347  9e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  58.65 
 
 		 310 aa  346  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  57.56 
 
 		 272 aa  340  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  56.93 
 
 		 277 aa  335  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  56.55 
 
 		 280 aa  328  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  54.48 
 
 		 279 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  56.57 
 
 		 282 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  58.05 
 
 		 280 aa  325  5e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  55.81 
 
 		 275 aa  324  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  56.02 
 
 		 269 aa  321  7e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  55.06 
 
 		 275 aa  321  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  55.43 
 
 		 280 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  53.7 
 
 		 283 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  54.18 
 
 		 278 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  53.93 
 
 		 275 aa  315  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  55.43 
 
 		 267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  52.81 
 
 		 267 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  54.81 
 
 		 294 aa  311  4.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  52.43 
 
 		 290 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  55.43 
 
 		 290 aa  311  6.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  53.93 
 
 		 280 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  54.44 
 
 		 271 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  54.48 
 
 		 294 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  51.3 
 
 		 292 aa  297  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  52.24 
 
 		 276 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  52.96 
 
 		 272 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  49.26 
 
 		 270 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  49.44 
 
 		 270 aa  278  6e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  44.19 
 
 		 273 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  41.6 
 
 		 271 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  42.05 
 
 		 260 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  41.85 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  40.08 
 
 		 288 aa  198  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  38.72 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  38.74 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  37.15 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  42.86 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  38.76 
 
 		 321 aa  168  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  39.32 
 
 		 281 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  36.94 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  34.65 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  38.4 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  37.6 
 
 		 327 aa  155  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  36.4 
 
 		 281 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  34.21 
 
 		 286 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  43.75 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  35.02 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  34.56 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  37.45 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  33.33 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  33.46 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  33.21 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  36.49 
 
 		 285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  41.94 
 
 		 367 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  35.84 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  35.96 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  42.13 
 
 		 257 aa  115  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  37.91 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  28.78 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  38.07 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  32 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  28.62 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  28.36 
 
 		 289 aa  99  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  32.83 
 
 		 268 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  30.53 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  30.53 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  30.53 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  34.12 
 
 		 258 aa  96.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  28.57 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  34.25 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  32.97 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  36.42 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  33.77 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  32.31 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  27.63 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  39.13 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  30.63 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  34.95 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  37.6 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  30.59 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  27.39 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  38.02 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  35.65 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  39.78 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  34.17 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  29.39 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  36.36 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  29.9 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  32.93 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  36.36 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>