More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3848 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 294 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  75.56 
 
 		 271 aa  434  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  68.89 
 
 		 272 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  60.22 
 
 		 269 aa  322  5e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  57.2 
 
 		 295 aa  316  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  57.41 
 
 		 276 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  54.81 
 
 		 275 aa  311  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  55.93 
 
 		 279 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  55.19 
 
 		 279 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  57.04 
 
 		 268 aa  301  8.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  55.93 
 
 		 267 aa  301  8.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  54.81 
 
 		 279 aa  301  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  54.07 
 
 		 270 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  56.3 
 
 		 280 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  55.56 
 
 		 275 aa  299  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  55.11 
 
 		 282 aa  296  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  53.87 
 
 		 275 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  53.7 
 
 		 279 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  53.07 
 
 		 278 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  53.87 
 
 		 275 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  54.44 
 
 		 283 aa  293  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  54.44 
 
 		 282 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  52.59 
 
 		 273 aa  289  4e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  53.65 
 
 		 272 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  53.7 
 
 		 283 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  53.36 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  53.7 
 
 		 277 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  52.86 
 
 		 280 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  51.79 
 
 		 292 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  52.19 
 
 		 270 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  52.94 
 
 		 294 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  52.19 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  51.47 
 
 		 280 aa  268  8e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  50.18 
 
 		 290 aa  265  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  50.55 
 
 		 276 aa  262  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  47.55 
 
 		 267 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  50.92 
 
 		 280 aa  259  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  47.92 
 
 		 290 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  48.05 
 
 		 273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  38.49 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  38.11 
 
 		 271 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  34.91 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  37.29 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  36.05 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  35.55 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  33.1 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  33.98 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  30.3 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  33.59 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  36.61 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  32.57 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  35.02 
 
 		 284 aa  139  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  34.62 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  30.27 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  31.12 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  37.72 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  41.58 
 
 		 291 aa  133  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  42.14 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  30.77 
 
 		 286 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  43.67 
 
 		 367 aa  128  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  37.1 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  31.01 
 
 		 286 aa  125  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  30.66 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  30.31 
 
 		 286 aa  122  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  39.62 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  40.7 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  37.21 
 
 		 254 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  29.41 
 
 		 267 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  30.66 
 
 		 260 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  31.7 
 
 		 269 aa  97.1  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  28.85 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  31.86 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  32.76 
 
 		 261 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  36.81 
 
 		 258 aa  94  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  37.27 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  32 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  35.37 
 
 		 268 aa  92  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  28.89 
 
 		 264 aa  87.8  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  35.84 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  27.14 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  27.14 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  27.14 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  35.42 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  27.57 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  28.33 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  26.89 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  39.34 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  32.89 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  26.58 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  32.42 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  28.99 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  26.39 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  30.57 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  32.68 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  33.62 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  31.79 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2203  transglutaminase domain protein  28.96 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.424742  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  28.72 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  25.93 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  25.93 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>