More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1265 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  100 
 
 
267 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  95.13 
 
 
290 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  61.05 
 
 
273 aa  353  2e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  59.18 
 
 
278 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  58.8 
 
 
275 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  58.05 
 
 
279 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  58.05 
 
 
275 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  57.3 
 
 
283 aa  329  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  55.06 
 
 
295 aa  322  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  54.68 
 
 
275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  54.31 
 
 
280 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  52.81 
 
 
275 aa  311  4.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  53.18 
 
 
283 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  53.56 
 
 
270 aa  308  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  52.81 
 
 
282 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  52.43 
 
 
310 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  52.81 
 
 
276 aa  305  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  53.93 
 
 
268 aa  304  9.000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  55.13 
 
 
267 aa  301  5.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  50.19 
 
 
279 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  54.2 
 
 
294 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  51.31 
 
 
279 aa  299  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  54.96 
 
 
269 aa  299  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  50.94 
 
 
279 aa  297  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  52.06 
 
 
277 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  50.18 
 
 
272 aa  291  8e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  51.31 
 
 
276 aa  291  9e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  52.65 
 
 
292 aa  291  9e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  53.05 
 
 
280 aa  290  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  50.56 
 
 
280 aa  287  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  49.81 
 
 
270 aa  278  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  49.81 
 
 
270 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  47.23 
 
 
282 aa  276  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  48.69 
 
 
290 aa  275  6e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  51.15 
 
 
280 aa  268  8e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  47.55 
 
 
294 aa  261  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  47.78 
 
 
271 aa  260  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  44.44 
 
 
272 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  41.35 
 
 
273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  40.84 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  40.15 
 
 
260 aa  192  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  38.95 
 
 
288 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  42.58 
 
 
266 aa  188  7e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  35.41 
 
 
276 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  39.62 
 
 
265 aa  178  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  38.28 
 
 
264 aa  175  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  39.15 
 
 
281 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  38.7 
 
 
298 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  37.84 
 
 
321 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  33.71 
 
 
266 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  37.98 
 
 
284 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  36.94 
 
 
298 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  35.45 
 
 
282 aa  166  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  36.43 
 
 
281 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  38.43 
 
 
286 aa  161  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  36.84 
 
 
291 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  37.6 
 
 
327 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  34.59 
 
 
285 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  34.93 
 
 
293 aa  151  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  34.75 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  36.54 
 
 
286 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  35.29 
 
 
367 aa  142  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  34.9 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  35.8 
 
 
286 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  35.8 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  33.97 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  31.27 
 
 
254 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  32.2 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  31.6 
 
 
261 aa  115  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  32.74 
 
 
264 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  29.55 
 
 
268 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  29.01 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  28.4 
 
 
260 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
289 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  39.52 
 
 
263 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  34.15 
 
 
271 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  26.12 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  31.09 
 
 
267 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  31.09 
 
 
280 aa  96.3  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  29.21 
 
 
272 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  29.21 
 
 
272 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  29.21 
 
 
272 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  35.52 
 
 
316 aa  88.6  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  33.02 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  35.33 
 
 
279 aa  82  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  29.87 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  27.4 
 
 
266 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  26.62 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  36.21 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  26.8 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  28.36 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  37.07 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  32.76 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  35.9 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  31.46 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  32.04 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  32.04 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  32.04 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  26.36 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  27.42 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>