More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3838 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  100 
 
 		 275 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  93.53 
 
 		 278 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  90.74 
 
 		 275 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  85.02 
 
 		 279 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  66.17 
 
 		 273 aa  388  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  61.11 
 
 		 283 aa  361  7.0000000000000005e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  60.45 
 
 		 294 aa  354  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  59.55 
 
 		 290 aa  338  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  60 
 
 		 295 aa  339  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  58.05 
 
 		 268 aa  338  5.9999999999999996e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  58.8 
 
 		 267 aa  338  7e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  57.68 
 
 		 270 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  56.77 
 
 		 292 aa  325  6e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  54.58 
 
 		 276 aa  323  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  55.06 
 
 		 275 aa  321  8e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  56.18 
 
 		 275 aa  318  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  56.13 
 
 		 280 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  55.15 
 
 		 280 aa  315  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  55.72 
 
 		 272 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  55.15 
 
 		 282 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  56.55 
 
 		 267 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  56.02 
 
 		 269 aa  308  5e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  53.82 
 
 		 279 aa  308  5e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  53.11 
 
 		 310 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  52.4 
 
 		 290 aa  305  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  55.72 
 
 		 280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  54.01 
 
 		 282 aa  301  9e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  52.03 
 
 		 280 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  52.42 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  52.04 
 
 		 279 aa  298  7e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  51.84 
 
 		 283 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  52.06 
 
 		 277 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  53.87 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  52.22 
 
 		 270 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  53.7 
 
 		 272 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  52.22 
 
 		 270 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  52.24 
 
 		 276 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  51.85 
 
 		 271 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  43.23 
 
 		 273 aa  215  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  37.74 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  36.94 
 
 		 288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  35.14 
 
 		 276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  39.84 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  38.85 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  37.13 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  35.83 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  32.84 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  33.83 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  33.72 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  35.77 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  36.09 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  34.93 
 
 		 282 aa  142  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  34.81 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  35.02 
 
 		 321 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  33.85 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  31.75 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  32.22 
 
 		 298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  34.73 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  35.23 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  33.58 
 
 		 327 aa  129  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  30.4 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  30.88 
 
 		 286 aa  116  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  30.88 
 
 		 286 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  30.88 
 
 		 286 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  31.01 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  29.67 
 
 		 286 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  36.09 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  27.61 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  34.27 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  33.33 
 
 		 271 aa  89.7  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  34.16 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  28.88 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  35.76 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  34.42 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  29.72 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  30.77 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  36.49 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  27.34 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  39.17 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  32.98 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  28.37 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  39.17 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  35.25 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  28.64 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  29.06 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  37.93 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  27.19 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  30.65 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  27.71 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  26.56 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  41.46 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  29.72 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  30.77 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  26.21 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  26.21 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  26.21 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  29.44 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  29.44 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  29.44 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  34.65 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>