More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0510 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  100 
 
 
293 aa  600  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  66.43 
 
 
327 aa  404  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  64.71 
 
 
321 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  58.89 
 
 
367 aa  328  5.0000000000000004e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  50.53 
 
 
286 aa  301  7.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  50.88 
 
 
285 aa  301  9e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  45.11 
 
 
281 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  42.35 
 
 
286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  41.57 
 
 
298 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  41.03 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  38.7 
 
 
286 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  38.7 
 
 
286 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  44.05 
 
 
298 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  38.6 
 
 
282 aa  202  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  43.09 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  43.09 
 
 
281 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  37.4 
 
 
286 aa  192  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  39.93 
 
 
291 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  35.58 
 
 
261 aa  169  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  38.74 
 
 
276 aa  166  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  39.11 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  39.84 
 
 
257 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  39.55 
 
 
271 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  34.93 
 
 
267 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  43.94 
 
 
279 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  42.93 
 
 
279 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  42.93 
 
 
279 aa  156  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  43.1 
 
 
268 aa  155  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  34.56 
 
 
290 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  43.66 
 
 
273 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  43.75 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  35.02 
 
 
260 aa  153  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  38.02 
 
 
260 aa  152  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  45.12 
 
 
266 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  34.59 
 
 
275 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  34.65 
 
 
254 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  39 
 
 
282 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  41.75 
 
 
276 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  42.37 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  40.7 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  40.7 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  34.31 
 
 
280 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  35.53 
 
 
266 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  40 
 
 
283 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  44.17 
 
 
270 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  44.17 
 
 
270 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  41.12 
 
 
283 aa  143  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  40.62 
 
 
270 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  36.57 
 
 
276 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  38.07 
 
 
273 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  38.83 
 
 
280 aa  142  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  43.4 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  42.17 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  34.96 
 
 
272 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  39.09 
 
 
267 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  35.45 
 
 
294 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  42.94 
 
 
269 aa  139  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  31 
 
 
261 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  40.99 
 
 
292 aa  139  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  38.5 
 
 
279 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  35.85 
 
 
280 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  37.13 
 
 
290 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  41.32 
 
 
272 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  42.14 
 
 
294 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  32.56 
 
 
264 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  28.99 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  41.07 
 
 
282 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  34.16 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  37.44 
 
 
268 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  30.4 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  34.74 
 
 
278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  35.38 
 
 
275 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  38.04 
 
 
268 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  37.14 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  35.43 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  35.45 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  33.64 
 
 
267 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  36.36 
 
 
271 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  33.18 
 
 
272 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  33.18 
 
 
272 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  33.18 
 
 
272 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  36.36 
 
 
279 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
269 aa  93.2  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  38.33 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  38.33 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  38.33 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  40 
 
 
281 aa  79  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  38.14 
 
 
280 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  30.92 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  36.07 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  35.53 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  32.05 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  28.19 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  30.67 
 
 
272 aa  72  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  34.19 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  44.58 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  26.27 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  38.79 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  38.79 
 
 
366 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  38.79 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>