47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2077 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2077  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 317 aa  662    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2471  transglutaminase domain-containing protein  30.42 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.534692  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1704  transglutaminase domain protein  27.65 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0326146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1856  transglutaminase domain-containing protein  32.57 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0548672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1997  putative protease  27.45 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000694194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3332  putative protease  27.7 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000192317  unclonable  3.65908e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2028  putative protease  27.03 
 
 		 386 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.6707700000000002e-61 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  25.56 
 
 		 1710 aa  67  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2073  protease, putative  27.03 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000121211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1509  transglutaminase domain-containing protein  27.52 
 
 		 386 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000210837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1852  protease  26.35 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000203248  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1823  murein endopeptidase  26.35 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.57805e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1807  murein endopeptidase  25.43 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1995  protease  26.35 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000762612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0169  hypothetical protein  28.12 
 
 		 629 aa  64.7  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2092  putative protease  26.35 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745261  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1858  transglutaminase domain-containing protein  24.42 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000428903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0881  S-layer domain-containing protein  26.06 
 
 		 578 aa  59.3  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000484445  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1491  hypothetical protein  26.06 
 
 		 530 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00542195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0484  S-layer domain-containing protein  26.99 
 
 		 586 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000124996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0884  S-layer protein  26.76 
 
 		 578 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000197101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  29.91 
 
 		 280 aa  57  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0900  S-layer protein  26.76 
 
 		 578 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000625317  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1056  putative S-layer protein  26.76 
 
 		 576 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.48899e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0916  S-layer protein  26.76 
 
 		 577 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0018351  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0981  s-layer protein  26.76 
 
 		 577 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000154114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4285  S-layer domain protein  26.06 
 
 		 577 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00013823  normal  0.102971 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1019  putative S-layer protein  26.06 
 
 		 577 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0271963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1072  S-layer protein, putative  26.06 
 
 		 578 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.043499  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1144  S-layer protein  26.06 
 
 		 578 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000385936  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03940  Transglutaminase-like superfamily protein  30.77 
 
 		 346 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.474674  normal  0.582976 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02467  conserved hypothetical protein  28.07 
 
 		 696 aa  55.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22960  Transglutaminase-like superfamily protein  26.09 
 
 		 424 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000122213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0068  transglutaminase domain protein  27.91 
 
 		 373 aa  53.1  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0531153  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0562  transglutaminase domain protein  30.07 
 
 		 398 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.567565  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0318  transglutaminase domain protein  27 
 
 		 480 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0843  putative lipoprotein  25.15 
 
 		 744 aa  51.6  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.277994  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08210  SH3 domain protein (Cyk3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03400)  24.39 
 
 		 1789 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0103  transglutaminase domain protein  27.97 
 
 		 343 aa  50.1  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  26.43 
 
 		 436 aa  46.6  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0514  putative lipoprotein  23.47 
 
 		 756 aa  46.6  0.0005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.492219  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  33.06 
 
 		 391 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  33.06 
 
 		 391 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22380  hypothetical protein  26.36 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2123  transglutaminase domain-containing protein  23.44 
 
 		 773 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.034622  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0607  putative lipoprotein  25 
 
 		 818 aa  45.4  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.256534  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  33.8 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>