172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0562 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0562  transglutaminase domain protein  100 
 
 
398 aa  812    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.567565  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  32.42 
 
 
391 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  31.66 
 
 
391 aa  186  7e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  41.55 
 
 
280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0068  transglutaminase domain protein  25.55 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0531153  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1556  transglutaminase domain-containing protein  40.17 
 
 
272 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  30.95 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0103  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  30.73 
 
 
328 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2471  transglutaminase domain-containing protein  29.68 
 
 
326 aa  62.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.534692  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  31.36 
 
 
467 aa  62.4  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  29.33 
 
 
1305 aa  60.1  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  27.72 
 
 
320 aa  60.1  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  32.35 
 
 
338 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  33.9 
 
 
436 aa  57.8  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  35.77 
 
 
336 aa  56.6  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  30.89 
 
 
631 aa  56.2  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0318  transglutaminase domain protein  26.62 
 
 
480 aa  56.2  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1807  murein endopeptidase  31.62 
 
 
386 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  25.4 
 
 
314 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  30.1 
 
 
266 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  34.82 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2073  protease, putative  30.88 
 
 
386 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000121211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3803  transglutaminase domain protein  33.06 
 
 
478 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3887  transglutaminase domain protein  28.87 
 
 
478 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.978849 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  34.96 
 
 
336 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  30.28 
 
 
216 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  25.28 
 
 
492 aa  53.9  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  28.37 
 
 
500 aa  53.1  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  27.46 
 
 
681 aa  53.5  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  31.09 
 
 
265 aa  53.1  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1852  protease  30.15 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000203248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1995  protease  30.15 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000762612  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  31.36 
 
 
373 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2092  putative protease  30.88 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1823  murein endopeptidase  30.15 
 
 
386 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.57805e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  27.83 
 
 
285 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2077  transglutaminase domain protein  30.07 
 
 
317 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1997  putative protease  30.15 
 
 
386 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000694194  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  29.82 
 
 
392 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  26.05 
 
 
271 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3332  putative protease  30.15 
 
 
386 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000192317  unclonable  3.65908e-25 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1343  transglutaminase domain-containing protein  33.6 
 
 
369 aa  51.2  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1509  transglutaminase domain-containing protein  29.08 
 
 
386 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000210837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2028  putative protease  30.15 
 
 
386 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.6707700000000002e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1858  transglutaminase domain-containing protein  29.71 
 
 
386 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000428903  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  30.83 
 
 
822 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1574  transglutaminase domain-containing protein  29.91 
 
 
453 aa  50.8  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000322367  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  26.5 
 
 
484 aa  50.4  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.538035 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_5312  predicted protein  36.21 
 
 
244 aa  50.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  30.83 
 
 
818 aa  50.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0938  transglutaminase domain-containing protein  32.35 
 
 
438 aa  50.4  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.522596  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  26.22 
 
 
754 aa  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  28.74 
 
 
277 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  26.97 
 
 
635 aa  49.7  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0607  putative lipoprotein  30.17 
 
 
818 aa  48.9  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.256534  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  23.84 
 
 
515 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  22.47 
 
 
691 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0013  transglutaminase domain protein  27.21 
 
 
376 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.854186  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  26.87 
 
 
298 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  28.83 
 
 
276 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0916  transglutaminase domain-containing protein  32.35 
 
 
438 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  27.87 
 
 
292 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  31.33 
 
 
271 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  37.93 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  29.21 
 
 
363 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  25.62 
 
 
485 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0148  transglutaminase domain-containing protein  31.5 
 
 
495 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  24.87 
 
 
571 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1491  hypothetical protein  33.68 
 
 
530 aa  47.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00542195  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  28.74 
 
 
310 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  35.9 
 
 
662 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4178  transglutaminase domain-containing protein  36.59 
 
 
485 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00683366  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  25.47 
 
 
310 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  27.91 
 
 
359 aa  47.8  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  28.87 
 
 
272 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  28.74 
 
 
283 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  26.23 
 
 
515 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  26.53 
 
 
294 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0413  transglutaminase domain-containing protein  33.82 
 
 
507 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.939018 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4075  transglutaminase-like  28.44 
 
 
515 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  29.76 
 
 
316 aa  47.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22960  Transglutaminase-like superfamily protein  29.73 
 
 
424 aa  47  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000122213  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  26.97 
 
 
275 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0665  transglutaminase domain-containing protein  34.15 
 
 
371 aa  47  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.713396  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  28.32 
 
 
795 aa  47  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  31.33 
 
 
680 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  26.88 
 
 
674 aa  46.6  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  32.26 
 
 
272 aa  46.6  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  28.57 
 
 
295 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0119  hypothetical protein  28.12 
 
 
361 aa  46.6  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  29.49 
 
 
730 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  28.57 
 
 
278 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  39.44 
 
 
767 aa  46.2  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  28.46 
 
 
862 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  23.97 
 
 
283 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  27.78 
 
 
271 aa  46.2  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  31.52 
 
 
760 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  26.98 
 
 
279 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  24.83 
 
 
762 aa  45.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>