250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3081 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  100 
 
 
280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  40.82 
 
 
391 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  40.82 
 
 
391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0562  transglutaminase domain protein  41.55 
 
 
398 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.567565  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0068  transglutaminase domain protein  32.53 
 
 
373 aa  88.6  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0531153  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0103  transglutaminase domain protein  25.1 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1556  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  26.76 
 
 
634 aa  76.6  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  31.48 
 
 
1305 aa  75.1  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  26.78 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  33.09 
 
 
436 aa  69.3  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  28.36 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2471  transglutaminase domain-containing protein  29.61 
 
 
326 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.534692  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  28.78 
 
 
266 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  26.47 
 
 
484 aa  63.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.538035 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  27.46 
 
 
730 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  30 
 
 
515 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  31.25 
 
 
485 aa  60.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  29.29 
 
 
515 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  26.21 
 
 
571 aa  59.7  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  26.22 
 
 
559 aa  58.5  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  28.78 
 
 
631 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4178  transglutaminase domain-containing protein  24.59 
 
 
485 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00683366  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  27.91 
 
 
635 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  26.36 
 
 
266 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1574  transglutaminase domain-containing protein  31.16 
 
 
453 aa  57.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000322367  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2855  transglutaminase domain protein  29.1 
 
 
276 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0224006  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  25.9 
 
 
260 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2077  transglutaminase domain protein  29.91 
 
 
317 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1807  murein endopeptidase  30.07 
 
 
386 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  25.24 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0514  putative lipoprotein  36.36 
 
 
756 aa  56.6  0.0000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.492219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3803  transglutaminase domain protein  27.34 
 
 
478 aa  56.2  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  23.65 
 
 
515 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  26.15 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1509  transglutaminase domain-containing protein  28.17 
 
 
386 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000210837  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  25.73 
 
 
286 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  23.53 
 
 
316 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1528  transglutaminase-like protein enzymes putative cysteine protease-like protein  33.6 
 
 
204 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2092  putative protease  30.07 
 
 
386 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745261  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02467  conserved hypothetical protein  26.75 
 
 
696 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  24.76 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  27.66 
 
 
338 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  23.5 
 
 
272 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  27.15 
 
 
216 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3887  transglutaminase domain protein  26.56 
 
 
478 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.978849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1704  transglutaminase domain protein  26.9 
 
 
423 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0326146  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  23.5 
 
 
272 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  23.5 
 
 
272 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  30.61 
 
 
254 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0148  transglutaminase domain-containing protein  29.45 
 
 
495 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  22.69 
 
 
265 aa  53.9  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2028  putative protease  29.41 
 
 
386 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.6707700000000002e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1823  murein endopeptidase  29.41 
 
 
386 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.57805e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0607  putative lipoprotein  35.35 
 
 
818 aa  53.1  0.000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.256534  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  26.26 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  28.23 
 
 
267 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1852  protease  28.76 
 
 
386 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000203248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1995  protease  28.76 
 
 
386 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000762612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0484  S-layer domain-containing protein  27.46 
 
 
586 aa  53.1  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000124996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2073  protease, putative  29.41 
 
 
386 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000121211  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  27.93 
 
 
467 aa  52.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3332  putative protease  29.08 
 
 
386 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000192317  unclonable  3.65908e-25 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  30.93 
 
 
289 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  28.03 
 
 
736 aa  52.4  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  26.17 
 
 
742 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00820  Transglutaminase-like Super Family Protein  34.18 
 
 
313 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  31.71 
 
 
500 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1997  putative protease  28.1 
 
 
386 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000694194  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1856  transglutaminase domain-containing protein  32.67 
 
 
363 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0548672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1858  transglutaminase domain-containing protein  28.17 
 
 
386 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000428903  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  27.45 
 
 
266 aa  52  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0900  S-layer protein  28.95 
 
 
578 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000625317  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  28.17 
 
 
1710 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  27.55 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0318  transglutaminase domain protein  26.72 
 
 
480 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0916  S-layer protein  28.95 
 
 
577 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0018351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0884  S-layer protein  28.07 
 
 
578 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000197101  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0981  s-layer protein  28.95 
 
 
577 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000154114  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1034  transglutaminase-like  23.5 
 
 
287 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  29.66 
 
 
336 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  26.36 
 
 
685 aa  50.4  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0348  transglutaminase domain-containing protein  31.52 
 
 
510 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.024702  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1056  putative S-layer protein  28.95 
 
 
576 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.48899e-34 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  26.36 
 
 
685 aa  50.4  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  27.11 
 
 
337 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0642  transglutaminase domain protein  30.71 
 
 
383 aa  50.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1144  S-layer protein  28.07 
 
 
578 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000385936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1072  S-layer protein, putative  28.07 
 
 
578 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.043499  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1117  transglutaminase domain-containing protein  25.66 
 
 
328 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.113705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  23.4 
 
 
281 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
366 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  25.81 
 
 
202 aa  48.9  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4285  S-layer domain protein  28.07 
 
 
577 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00013823  normal  0.102971 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  27.37 
 
 
272 aa  48.9  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1019  putative S-layer protein  28.07 
 
 
577 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0271963  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  24.29 
 
 
790 aa  48.9  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  29.55 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2128  transglutaminase domain protein  28.45 
 
 
362 aa  48.5  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  29.55 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>