More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3803 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3887  transglutaminase domain protein  91.63 
 
 		 478 aa  872    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.978849 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3803  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 478 aa  964    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4178  transglutaminase domain-containing protein  55.35 
 
 		 485 aa  543  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00683366  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  53.76 
 
 		 484 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.538035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  47.88 
 
 		 515 aa  444  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  45.02 
 
 		 492 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  43.83 
 
 		 485 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0148  transglutaminase domain-containing protein  28.1 
 
 		 495 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  25.75 
 
 		 515 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0348  transglutaminase domain-containing protein  27.81 
 
 		 510 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.024702  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  25.75 
 
 		 515 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4075  transglutaminase-like  26.25 
 
 		 515 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  34.34 
 
 		 1305 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3474  transglutaminase domain-containing protein  37.59 
 
 		 528 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.934792  normal  0.0999002 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5617  transglutaminase domain protein  45.45 
 
 		 517 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0710722 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3413  transglutaminase-like  36.92 
 
 		 523 aa  67.8  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3562  transglutaminase domain protein  35.94 
 
 		 523 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.209631  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3494  transglutaminase domain protein  35.94 
 
 		 523 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  34.78 
 
 		 559 aa  65.1  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0784  transglutaminase domain protein  33.96 
 
 		 525 aa  63.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5097  hypothetical protein  44.16 
 
 		 297 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0177  transglutaminase-like protein  46.67 
 
 		 324 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  29.66 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  29.66 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  30.72 
 
 		 634 aa  61.2  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  25.87 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  31.58 
 
 		 314 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  29.77 
 
 		 571 aa  59.7  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1984  transglutaminase-like  40.23 
 
 		 291 aa  59.7  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  34.83 
 
 		 269 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5604  transglutaminase domain-containing protein  40.45 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.639349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  29.76 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  34.06 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2008  transglutaminase domain protein  40.26 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1814  transglutaminase domain protein  40.26 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.070269  hitchhiker  0.00579618 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  30.69 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  28.45 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  29.58 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  30.94 
 
 		 794 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  27.34 
 
 		 280 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4755  transglutaminase domain protein  35.4 
 
 		 302 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  35.96 
 
 		 275 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  27.42 
 
 		 327 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4075  transglutaminase domain-containing protein  39.47 
 
 		 287 aa  55.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3334  transglutaminase domain protein  38.55 
 
 		 1139 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387126  normal  0.0234354 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0562  transglutaminase domain protein  30.28 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.567565  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1847  transglutaminase-like  37.36 
 
 		 300 aa  55.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04320  transglutaminase domain protein  35.04 
 
 		 1118 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  32.29 
 
 		 286 aa  54.7  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  37.88 
 
 		 265 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  34.25 
 
 		 266 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  36.99 
 
 		 266 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  38.38 
 
 		 258 aa  53.9  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12586  hypothetical protein  36.14 
 
 		 1140 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.265908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1034  transglutaminase-like  37.04 
 
 		 287 aa  53.9  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00820  Transglutaminase-like Super Family Protein  41.89 
 
 		 313 aa  53.9  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2984  transglutaminase domain protein  35.35 
 
 		 302 aa  53.9  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  28.43 
 
 		 266 aa  53.5  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1621  transglutaminase domain-containing protein  31.82 
 
 		 1091 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0187167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0892  transglutaminase domain protein  37.35 
 
 		 277 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3010  transglutaminase-like  32.48 
 
 		 1117 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.424161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4135  transglutaminase-like  36.63 
 
 		 304 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0967  transglutaminase-like  40.26 
 
 		 301 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  hitchhiker  0.00428968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3978  transglutaminase-like  40.26 
 
 		 304 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  23.81 
 
 		 266 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3771  transglutaminase domain-containing protein  36.14 
 
 		 1133 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510583  normal  0.20356 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2753  transglutaminase-like  35.4 
 
 		 288 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0168  transglutaminase-like  43.18 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3099  transglutaminase-like domain-containing protein  36.14 
 
 		 1116 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.595628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5163  transglutaminase domain protein  38.36 
 
 		 279 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2315  Protein of unknown function DUF2126  32.84 
 
 		 1155 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0702822  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2051  Protein of unknown function DUF2126  36.79 
 
 		 1078 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.238647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  30.71 
 
 		 281 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2628  transglutaminase domain-containing protein  36.14 
 
 		 1112 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1555  transglutaminase domain-containing protein  34.18 
 
 		 290 aa  51.6  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  28.71 
 
 		 293 aa  51.6  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 326 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  35.87 
 
 		 282 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  36.04 
 
 		 269 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0068  transglutaminase domain protein  38.89 
 
 		 373 aa  51.6  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0531153  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  34.09 
 
 		 254 aa  51.6  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3281  transglutaminase-like domain-containing protein  42.86 
 
 		 302 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1823  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  34.33 
 
 		 632 aa  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2855  transglutaminase domain protein  35.62 
 
 		 276 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0224006  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1496  transglutaminase domain protein  31.34 
 
 		 1188 aa  51.6  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  34.48 
 
 		 273 aa  51.6  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  29.45 
 
 		 680 aa  51.2  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0177  transglutaminase domain protein  35.14 
 
 		 327 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1814  transglutaminase domain protein  37.93 
 
 		 302 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.853279 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2558  transglutaminase-like  39.76 
 
 		 1090 aa  51.2  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.884999  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1408  transglutaminase domain protein  33.59 
 
 		 302 aa  51.2  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.543659 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0188  transglutaminase domain protein  35.14 
 
 		 327 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00321272  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  35.37 
 
 		 268 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  28.57 
 
 		 282 aa  51.2  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9053  hypothetical protein  36.9 
 
 		 273 aa  51.2  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  32.43 
 
 		 276 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  27.78 
 
 		 310 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  32.43 
 
 		 276 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1509  transglutaminase domain-containing protein  27.54 
 
 		 386 aa  50.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000210837  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  32.2 
 
 		 500 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>